https://github.com/marbl/CHM13 截至2022年5月,目前的版本有v2.0,v1.1,v1.0等等 因为这个测是一个纯合子的完全性葡萄胎的细胞系,所以本来是没有Y染色体的,所以v2.0整合了来自GIAB HG002 样本重chY信息进去,使得参考基因组更完整 重点介绍一下v2.0中几个重要的参考基因组 chm13v2.0.fa.gz sequence name 以...
与GRCh38相比,T2T-CHM13中独特鉴定的尼安德特人序列约为51.3Mb(图2d),其中约1.68Mb位于T2T-CHM13新解析的区域(8%基因组)内。由于算法差异使得GRCh37与GRCh38和T2T-CHM13的可比性较差,该研究的后续分析主要集中在GRCh38和T2T-CHM13之间的比较。 图2. 三个参考基因组中尼安德特人祖先序列的比较。 研究团队在...
与GRCh38相比,T2T-CHM13中独特鉴定的尼安德特人序列约为51.3Mb(图2d),其中约1.68Mb位于T2T-CHM13新解析的区域(8%基因组)内。由于算法差异使得GRCh37与GRCh38和T2T-CHM13的可比性较差,该研究的后续分析主要集中在GRCh38和T2T-CHM13之间的比较。 打开网易新闻 查看精彩图片 图2. 三个参考基因组中尼安德特人...