T2T基因组是指有一条或者多条染色体达到端粒到端粒(Telomere-to-Telomere)水平的基因组,T2T基因组完成图是基因组组装的终极目标。ONT超长序列(N50大于100Kb)可实现T2T基因组的组装,结合HiFi和二代数据,能够得到高质量的T2T基因组。 人类及多个...
该成果填补了猪T2T基因组组装领域空白，为猪遗传育种和功能基因挖掘提供了高精度“蓝图”，标志着我国猪基因组研究迈入“完整解析”新时代。图 以民猪完成国际首例猪T2T全基因组组装 该成果以我国北方代表性地方猪种——民猪为研究对象，基于三代测序、ONT、Hi-C等前沿技术，完成了民猪T2T基因组组装，不仅实现了猪...
2. GapFiller:利用长读长序列(long reads)填补基因组中染色体缺口(gap)的工具。 3. TeloExplorer:鉴定基因组中端粒结构特征的工具。 4. CentroMiner:鉴定基因组中着丝粒结构特征的工具。 基于已发布的猕猴桃T2T参考基因组Hongyang v4.0的原始测序数据,...
1月8日，中国农业大学动物科学技术学院李孟华教授团队在国际知名学术期刊《自然·遗传》（Nature Genetics）发表论文《绵羊T2T基因组组装鉴定与毛用性状相关的变异》（Telomere-to-telomere sheep genome assembly identifies variants associated with wool fineness），首次完成了中国著名的高繁殖力品种——湖羊的端粒到端粒...
purpureum于约300万年前分化,并与AGK相比显示了类似的染色体组型,但同源基因之间的序列相似性在不同染色体对之间有所不同。JUJUNCAO中的着丝粒结构在T2T基因组组装中,实现着丝粒的高连续性是一个主要挑战之一。在这里,完整的基因组使我们能够注释所有14条染色体的着丝粒。我们在JUJUNCAO基因组中鉴定出三种类型的高序列...
随着基因组组装技术的发展,越来越多物种的T2T基因组被陆续发表。这些成果大多集中在基因组较小的物种上(基因组<1G),大基因组物种由于高重复序列含量、高杂合度和高倍性等问题,在组装上面临着更多的技术挑战。令人振奋的是,近期物种的T2T基因组组装(参考基因组>2Gb)取得了显著的突破,众多重要的研究成果相继问世。小...
T2T基因组不仅可以为群体遗传研究、基因功能定位提供最全面的参考基因组信息，还可以对着丝粒与端粒区域进行结构与功能分析。着丝粒是真核生物染色体的重要结构，在细胞分裂中起着不可或缺的作用。着丝粒功能障碍常导致细胞分裂过程中染色体分离不正确，从而影响生长发育。檀香（Santalum album），是檀香科、檀香属植物，原...
齐鲁网·闪电新闻2月25日讯 近日，闪电新闻记者从山东省自然资源厅获悉，山东省林草种质资源中心专家团队破解国家重点保护野生植物-玫瑰T2T基因组。据了解，野生玫瑰（Rosa rugosa）是国家重点保护野生植物，隶属于蔷薇科蔷薇属。蔷薇属植物是世界上最受欢迎和栽培最广泛的观赏植物之一。先前发布的玫瑰基因组都有大量未...
在植物基因组学领域，陆续发表了多个重要的模式物种如拟南芥、水稻等的T2T基因组（图1）。迄今为止，已发表的有关植物T2T基因组的文章已有几十篇，并且仍在迅速增长，T2T基因组已经成为基因组学研究的重要基础。图1 代表性植物T2T基因组及应用 Figure 1 Representative plant T2T genomes and their applications T2T...
T2T(Telomere-to-Telomere)级别基因组通过整合第三代长读长测序技术、高精度组装算法及多组学验证手段,首次实现染色体末端重复区域、着丝粒异染色质区等复杂结构的完整破译,标志着基因组学研究迈入新纪元。例如,2022年T2T联盟发布的CHM13-T2T人类参考基因组填补了GRCh38参考序列中超过200兆碱基的空白区域,修正了原参考...