须臾之间,我们已经迎来了酷暑的七月,在过去的半年中,科研工作者们在Nature Plants、Nature Genetics、Nature Communications、Plant Communications等顶级期刊上发表了多篇涉及水果、乔木、作物、蔬菜、中药等各种类别物种的高水平T2T基因组文章,随着多种测序技术结合,使得基因组端粒、着丝粒等未知领域能够被探索,为动植物的...
须臾之间,我们已经迎来了酷暑的七月,在过去的半年中,科研工作者们在Nature Plants、Nature Genetics、Nature Communications、Plant Communications等顶级期刊上发表了多篇涉及水果、乔木、作物、蔬菜、中药等各种类别物种的高水平T2T基因组文章,随着多种测序技术结合,使得基因组端粒、着丝粒等未知领域能够被探索,为动植物的...
(1)2021年6月,Molecular Plant背靠背发表两篇水稻T2T基因组,第一篇研究者采用高深度的HiFi和CLR测序,组装出0 gap的ZS97和MH63 R3版本参考基因组(基因组大小分别为391.56Mb和395.77Mb),基于Gap free的参考基因组,研究者对水稻12条染色体上着丝粒区域的结构和功能进行了详细研究;第二篇基于HiFi组装、与参考基因组比...
该研究结合PacBio HiFi、ONT超长和HIC测序技术,组装了首个野生蓝莓-云南越桔的T2T gapfree基因组,利用高质量的野生蓝莓T2T基因组序列助力分析了云南越桔中可溶性糖和有机酸积累代谢机制以及花青素积累的关键调控因子,同时,高质量的基因组能够促进蓝莓比较基因组学和进化生物学研究,推动蓝莓的驯化和育种研究。 8 2023.10 ...
3、枣和酸枣单倍型T2T基因组(2024.03 期刊:Horticulture Research) 项目文章|枣和酸枣单倍型T2T基因组揭示其驯化机制 贝纳基因参与本项目高质量分型T2T基因组的测序与组装工作。 本研究结合Illumina、PacBio HiFi、ONT和Hi-C测序技术,组装了高质量的栽培种枣及野生酸枣的染色体水平基因组,为进一步了解枣基因组进化和鉴定...
01项目文章一|鲁山冬凌草高质量T2T基因组组装揭示了两种冬凌草的基因组结构差异英文标题:High-quality assembly of the T2T genome for Isodon rube
美国加州大学Karen H. Miga教授和华盛顿大学Evan E. Eichler教授合作在The American Journal of Human Genetics发表了观点文章“Envisioning a new era: Complete genetic information from routine, telomere-to-telomere genomes”,阐述了现阶段人类T2T基因组组装为人类遗传学领域带来的改变,预测了完整基因组时代对人类健...
因此推测在G. pentaphyllum和P. ginseng中,DS是独立进化的。 总之,该研究完成了绞股蓝的高质量T2T基因组组装,并对基因组中鉴定出的11个候选OSCs基因中的一个DS进行了功能表征,为解析达玛烷型三萜皂苷生物合成机制提供了参考意义,有利于绞股蓝在达玛烷型皂苷衍生药物方面的开发应用。
自T2T联盟在2022年4月发布首个完整人类基因组序列以来，T2T基因组项目取得了显著进展。近一年内，通过ONT超长测序和PacBio Revio system的应用，已有超过50篇研究论文围绕这一主题发表，T2T基因组逐渐被视为未来基因组研究的黄金标准。以下为贝纳基因在T2T基因组领域的几个重要项目文章摘要：2022年6月，贝纳...