流式中文网 文献:Global characterization of T cells in non-small-cell lung cancer by single-cell sequencing T 细胞(全部):CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef(效应T细胞): 辅助T细胞(Helper T):CD3+CD4+CD8-T细胞 Th1: CD3+CD4+CD30-, IL-12R, CXCR...
单细胞测序可以发现关键的细胞亚群及分子信号。而单细胞蛋白组例如CyTOF可以在蛋白水平进行验证,同时也可以鉴定关键的细胞亚群及特征性蛋白marker。最重要的是以Isoplexis为主要技术的单细胞功能蛋白组会进一步的在单细胞功能性层面验证和揭示关键的CAR-T细胞的多功能性与患者预后的相关性。 华盈生物可以提供单细胞多组学...
单细胞测序可以发现关键的细胞亚群及分子信号。而单细胞蛋白组例如CyTOF可以在蛋白水平进行验证,同时也可以鉴定关键的细胞亚群及特征性蛋白marker。最重要的是以Isoplexis为主要技术的单细胞功能蛋白组会进一步的在单细胞功能性层面验证和揭示关键的CAR-T细胞的多功能性与患者预后的相关性。 华盈生物可以提供单细胞多组学不...
1. 和传统 CD8 T 细胞一样都表达 T 细胞受 体 (T cell receptor,TCR),但其激活不依赖树突细胞(Dendritic Cell,DC),此特性使其更接近先天性淋巴细胞(Innate lymphoid cell)。 2. 不同于传统 CD8 T 细胞,ILTCK 不表达 PD-1 和其他免疫抑制受体,因此不会进入细胞耗竭状态,反而对肿瘤细胞有更强大的细胞毒性...
既然做单细胞分析,那就需要确定具体的细胞类型,根据生物学背景常识知识,一般肯定是需要根据marker收集到具体的神经干细胞,起到辅助作用的间质细胞,以及作用强大而意义不明的免疫细胞。通过单细胞测序技术,分析不同年龄下干细胞发生了什么改变,间质细胞又发生了什么改变,以及免疫细胞出现了什么变化。
对浸润性肿瘤淋巴细胞的综合性的研究,可以帮助我们了解免疫治疗方法,以及预测这些细胞对临床治疗的反应。 研究样本: 来自6个肝癌患者的外周血、肿瘤组织、癌旁组织中的5063个肿瘤浸润性淋巴细胞。 分析手段:转录组、 T cell receptor (TCR) 测序相结合。
对白血病细胞的一些表面marker的基因表达进行评估,并与其诊断时的免疫表型进行匹配。与靶向DNA测序数据一致,XB47患者只含有47%的白血病T细胞。 05 T-ALL突变可以在CD34+CD38-多能干细胞中启动 CD34+CD38-细胞与其他样本一样的测序和质控标准。 4个T-ALL患者中有2个患者(X09, XB41)的CD34+CD38-祖细胞显示高度突...
"Ptprc"#免疫细胞 ) VlnPlot(allseu,features = celltype_marker,pt.size = 0,ncol = 2) 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 类似这样,如果某群cluster表达了不太可能同时出现的gene,则有可能是doublet。当然也要凭借一些「经验」,比如成纤维的marker可能在内皮细胞中有「一定程度」的表达,CD...
文章中仿佛并没有去batch,而是直接将所有的细胞直接聚类,是因为数据的质量太好,还是因为本来就没有多大的batch呢? T细胞应该分几类怎么选的呢?手动调节然后看marker的吗? 参考文献: 1、Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing ...
其实两种单细胞蛋白组学是在不同的维度上解释细胞的异质性。CyTOF主要是对细胞的表型进行表征,可以同时分析40多种表面或胞内的蛋白,主要是以这些marker分析关键的细胞亚群。而Isoplexis是直接检测单个细胞分泌的功能性细胞因子,主要是表征的细胞亚群的功能。因此在对CAR-T细胞进行效能或质量评估时,兼顾两种技术带来的表型...