001、conda直接安装 conda install -c bioconda stringtie 002、调用测试 root@DESKTOP-A31BQ38:~/anaconda3/bin#./stringtie --help |headStringTie v2.1.7usage: stringtie<in.bam ..> [-G <guide_gff>] [-l <prefix>] [-o <out.gtf>] [-p <cpus>] [-v] [-a <min_anchor_len>] [-m <m...
如果你使用的是conda环境管理器,你也可以通过conda来安装StringTie,这通常可以简化安装过程并自动处理依赖项。你可以使用以下命令来通过conda安装StringTie: bash conda install -c bioconda stringtie 在使用StringTie之前,请确保你的RNA-Seq数据已经过适当的预处理,并且已经对齐到参考基因组上。StringTie的输入通常是按坐...
解决了alpine镜像的Glibc问题,现在我们就可以安装miniconda了,具体安装命令如下: # configure environmentENVCONDA_DIR/opt/condaENVPATH$CONDA_DIR/bin:$PATHENVCONTAINER_UID1000ENVINSTALLERMiniconda2-latest-Linux-x86_64.shRUNcd/tmp&&\ mkdir-p$CONDA_DIR&&\ wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda2...
3.1root下安装,所以无需写bashrc #anaconda search -t conda hisat2 #anaconda show bioconda/hisat2 #conda install --channel https://conda.anaconda.org/bioconda hisat2 运行 #hisat 没问题 3.2如果普通用户,则需要写入bashrc #vi ~/.bashrc #export PATH=~/home/radish/bio_soft/hisat2-2.2.0/hisat...