1、 conda create -n xxx yyy #创建xxx环境,并安装yyy软件 2、 conda create -n xxx y=n.n #创建xxx环境时,并指定环境的依赖版本 3、 conda remove -n xx --all #删除已创建的xx小环境及安装的包 4、 conda create -n [new] --clone [old] #将old克隆为new 5、 conda search [SOFTWARE] #...
7. conda环境安装软件 创建好独立的小环境之后就可以在小环境内安装软件,首先要查找下自己想安装的软件是否可以用conda安装。不在base环境中安装软件是为了避免各个软件依赖环境之间的冲突,如果确定安装的软件不会产生冲突就可以在base环境中安装,另外在base环境安装的软件在各个小环境中都可使用。 (1) 网站查询 https...
这里有点类似R包的安装,装后需要library()一下,才能确认安装成功 安装方法:conda install -y sra-tools trim-galore 参数解释:-y要不要均可,是问你同不同意安装,不要的时候,需要手动输入一个y,自己尝试后就理解了这句话含义;sra-tools trim-galore安装两款软件,默认安装最新版; 注意 trim-galore 一个字都...
在官网下载安装anaconda :blog.csdn.net/weixin_73 安装驱动cuda:blog.csdn.net/lxlyhwl/a 安装驱动: blog.csdn.net/qq_545751 nvidia-smi #查看CUDA安装正确与否 conda create -n sdxx -y python=3.12 #创建环境 -y 表示自动确认所有提示,跳过用户确认步骤 conda env list #查看已安装环境 conda env remove...
在使用conda进行安装时,加上参数-y可以自动确认安装过程,无需手动确认每一步。这使得安装过程更加简洁和方便。 1)spyder:集成开发环境。 conda install -y spyder 1. 通常来说不需要再额外安装numpy了。因为spyder中已经预装了numpy,保险起见下面都装了
conda install -y bwa star ##两个常用的比对软件 conda install -y samtools conda install -y bcftools conda install -y vcftools snpEff conda install -y multiqc qualimap featureCounts 每装一个软件都可以使用--help来查看它是否安装成功,如果弹出帮助信息说明安装成功。
【结论】conda和Anaconda没有必然关系, 你可以不安装Anaconda的同时, 使用conda安装和管理软件。 1.1 Miniconda 简介 Miniconda是一个更小的Anaconda发行版(Anaconda是一个包含大量预装数据科学和机器学习库的Python发行版),它只包含conda包管理器和Python以及其必要的库。
首先，检查Mac的环境变量，确认conda虚拟环境路径已添加（需确保其在系统路径中可见）。接着，通过命令行查看已存在的conda虚拟环境列表。接着，进入创建新环境的阶段，通过conda create命令进行，创建时可选择是否安装初始所需的包，输入'y'进行安装。在新创建的环境中，你需要安装所需的库。具体步骤包括...
具体操作包括软件安装，如使用conda安装Blast。搜索可用软件可通过anaconda.org或bioconda.github.io。要指定软件版本，如fastqc 0.11.7，可以添加版本号并使用-y参数跳过确认。Mamba作为Conda的加速版本，提供了更快的下载和并行安装，且在base环境中的包无需重复安装。mamba可用于搜索、安装软件，并显示软件...