你好!smart-seq是一个细胞建一个文库,因此价格是按照细胞数目进行计算的,这决定了当细胞通量达到较大...
SMART-seq(Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript)是2012年开发的一种单细胞转录组测...
在操作上,smart-seq属于低通量技术,操作步骤类似于bulk RNAseq,包括细胞裂解、RNA分离、反转录、扩增和建库等。此过程多由人工完成,每一步清晰可控,可保存总RNA、cDNA,甚至调整样品量,并在cDNA扩增后加入质检步骤。相比之下,10x Genomics技术处理大量细胞,随机捕获,确保每个测序droplet中最多只有一...
Smart-seq2和10X技术是单细胞转录组测序两种常用的方法。它们在样本处理、测序深度、覆盖度和数据分析等方面存在一些区别。 一、样本处理: 1.Smart-seq2: 这种方法需要对单个细胞进行分离和捕获,然后进行细胞裂解和逆转录反应,最后进行扩增和测序。这种方法通常需要较长的操作时间和较高的技术要求。 2.10X技术: 这种...
Smart-seq为全转录组扩增,其基于 oligo-dT引物和模板置换技术从而扩增CDNA全长,,覆盖量高,测序所得...
发现空间变异性特征 与单细胞RNA测序数据的整合 处理多个样本切片 首先,将加载Seurat及其所需的其他包以...
一般smart-seq都是手工做(或者换液的robot),一步一步加样品、吸样品,你知道每一步加的是什么、做...
并在油滴中进行细胞溶解和RNA逆转录反应,生成cDNA。而smart-seq则通过直接在单个细胞中进行RNA提取和逆...
Smart-Seq2建库原理 1. 单细胞分选:Smart-seq2使用流式细胞仪或显微操作进行细胞分选,体积不超过0....