SMART-seq（Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript）是2012年开发的一种单细胞转录组测...
你好！smart-seq是一个细胞建一个文库，因此价格是按照细胞数目进行计算的，这决定了当细胞通量达到较大...
Smart-seq2和10X技术是单细胞转录组测序两种常用的方法。它们在样本处理、测序深度、覆盖度和数据分析等方面存在一些区别。 一、样本处理: 1.Smart-seq2: 这种方法需要对单个细胞进行分离和捕获,然后进行细胞裂解和逆转录反应,最后进行扩增和测序。这种方法通常需要较长的操作时间和较高的技术要求。 2.10X技术: 这种...
在操作上，smart-seq属于低通量技术，操作步骤类似于bulk RNAseq，包括细胞裂解、RNA分离、反转录、扩增和建库等。此过程多由人工完成，每一步清晰可控，可保存总RNA、cDNA，甚至调整样品量，并在cDNA扩增后加入质检步骤。相比之下，10x Genomics技术处理大量细胞，随机捕获，确保每个测序droplet中最多只有一...
Smart-seq为全转录组扩增，其基于 oligo-dT引物和模板置换技术从而扩增CDNA全长，，覆盖量高，测序所得...
这是一种计算技术,当提供单细胞RNA测序(scRNA-seq)参考数据时,可以用来从空间数据集中反推斑点级别的数据。RCTD已被证实能够精确地对来自SLIDE-seq、Visium和10x公司的Xenium in-situ空间平台等多种技术的空间数据进行注释。 要执行RCTD,我们首先需要从GitHub上安装spacexr包,这个包提供了RCTD的实现。 devtools::...
Smart-seq2和10x Genomics Chromium是两种广泛应用于单细胞转录组测序的技术，它们在多个方面存在区别：比...
Smart-seq2和10x Genomics Chromium是两种广泛应用于单细胞转录组测序的技术，它们在多个方面存在区别：比...
并在油滴中进行细胞溶解和RNA逆转录反应，生成cDNA。而smart-seq则通过直接在单个细胞中进行RNA提取和逆...
发现空间变异性特征 与单细胞RNA测序数据的整合 处理多个样本切片 首先，将加载Seurat及其所需的其他包以...