单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing,ScRNA-Seq)是一项在单细胞水平对转录组进行高通量测序和分析的新技术,可获得单个细胞内近万个基因的特异表达信息,同时解决bulk测序无法解决的细胞异质性难题,为辨别生物组织中各细胞的转录组特征、解析单细胞的行为、机制及其与机体的关系提供有力的工具。单细胞测序种类繁...
Smart-seq是一个全长转录组的测序，10x 单细胞只针对3’端或5’端的150bp的测序，因此，如果想要关注...
Smart-seq2单细胞转录组测序 Smart-seq2 单细胞转录组测序通过 SMART 扩增技术对单个细胞中的 mRNA 进行逆转录和 PCR 扩增,结合转座酶建库技术,最终使用高通量测序手段,对单细胞中 mRNA 进行基因表达定量、功能富集、代谢通路等分析。它可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在...
Smart-seq是由路德维格癌症研究所的Rickard Sandberg实验室所开发的一套在全转录组范围进行单细胞RNA测序 (scRNA-seq)的方法。Smart-seq因为以全长mRNA建库,所以对转录本的测序覆盖度也有所上升。Smart-seq2是由Picelli等人从Smart-seq中改良而来(Picelli et al., 2013)(Picelli et al., 2014)。本文将从Smart-se...
一般smart-seq都是手工做（或者换液的robot），一步一步加样品、吸样品，你知道每一步加的是什么、做...
Smart-seq3xpress—全长转录组测序,为您深度解析单细胞 28:38 “新”“新”向荣,求索不止——GEM-X & Flex专题线上讲座 17:18 让AI为科研赋能——百奥智汇“单细胞+AI”主题系列直播第一讲 49:28 所见即所得,视界新选择---Visium HD专题讲座 26:05 百奥智汇“单细胞+AI”主题系列直播第二讲...
Smart-seq2是经Smart-seq改进的一种测序方法,也目前最常用的单细胞转录组技术之一。 Smart-seq2 通过设计oligo(dT)VN Primer作为逆转录引物,利用MMLVRT的模板转换活性,在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行反转录,生成cDNA第一条链。当逆转录酶到达mRNA5’末端时,会连续在末端添加几个胞嘧啶(C)残...
SMART-seq(Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript)是2012年开发的一种单细胞转录组测序技术,它的原理是通过在反转录过程中引入一个定制引物,将细胞内的RNA转录本进行全长合成,使得可以获得单细胞水平上更详细和全面的基因表达数据。 2013年,Nature Methods 杂志上报道了 SMART-seq2,该技术是经 SMAR...
SMART-seq(Switching mechanism at 5’ end of the RNAtranscript)是由美国和瑞典科学家于2012年共同开发的一种单细胞转录组测序技术,其能够检测mRNA 的全长,从而实现了转录本异构分析分析和 SNV 检测。2013年,Nature Methods 杂志上报道了 SMART-seq2,该技术是经 SMART-seq 改进的一种测序方法,也是目前最常用的...