scRNA-seq单细胞测序技术可对分散的单个细胞分别进行基因组、转录组、表观遗传组或多组学测序,可从较少的肿 瘤细胞中获得取可能多的信息。其过程和原理,首先就是给一个bead表面合成无数含有polyT的反转录引物(一个磁珠上含有的polyT引物数量可以高达10的8次方个),然后将每一个磁珠和一个单细胞通过微流控技术放到...
PETRI-seq和microSPLiT是之前在Nature Microbiology和Science上发表的2种细菌scRNA-seq方法,使用随机引物进行逆转录及分裂池标记策略,同时对成千上万固定细菌同时进行检测;在大规模研究细菌群落异质性上有了很大的进步。但组合分裂池标记策略需要在96孔板中进行多次反应,并不是高通量scRNA-seq的合适平台,且检测到的基因数...
内容概要:介绍了scRNA-seq技术的基本过程和发展,并探讨了其在癌症研究和临床实践中的应用。癌症是一组异质性疾病,scRNA-seq技术可以帮助我们理解肿瘤异质性和肿瘤微环境,从而更好地了解肿瘤发生、进展、转移和药物耐受性的机制。 2、内源性腺嘌呤介导糖尿病模型的肾损伤并预测患者的糖尿病肾病 Endogenous adenine media...
单细胞RNA测序可(scRNA-seq)揭示肿瘤微环境的特征,更好地将这些特征与癌症预后联系起来,对制定癌症治疗方案具有指导意义。 scRNA-seq在TME中的重要研究结果[1] 研究案例(一) 为了研究肿瘤微环境(TME)特征,探究细胞状态失调的关键因素,Sathe A等人对7名GC患者和1名胃肠化生(GIM)患者的手术切除或活检组织、配对的...
该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了比克氏棉子叶GoPGF的结合基序和下游靶基因。并进一步揭示了比克氏棉色素腺形态建成的调控网络,为培育具有特定性状的栽培棉花新品种提供了宝贵的基因资源。 从萌发的比克氏棉子叶中分离原生质体,进行单细胞RNA测序(scRNA-seq),保留了12222个单细胞转录组数据用于下游分析。
对正常人肝组织进行scRNA-seq鉴定出TROP2int祖细胞群,其具有在体外形成肝器官样的潜能。此外scRNA-seq技术发现LSECs通过Tie2/Wnt信号通路促进肝细胞再生,表明微环境在肝再生中也发挥着重要作用。 scRNA-seq, ST-seq 在肝病研究中的应...
单细胞测序技术首次由Tang et al. 于2009年发表,用以比较单细胞测序和微芯片技术。2011年Islam et al.创建了第一个复用scRNA测序库,它的规模和通量的增加为3年后scRNA-seq的广泛普及奠定了基础。新平台只需两步就可以使单细胞分离和文库生成,它的出现改变了单细胞测序成本高、人力需求高且protocols有限的现状。dr...
单细胞测序技术scRNA-seq及其在动物学上的应用 《动物学科学研讨》课程老师让介绍一种测序技术,及其在动物学上的应用的,PPT共享! (每帖分享:时间应该被用在有价值且让你快乐的地方,而不是无意义且扰乱心情的事情)
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scRNA-seq能够在单个细胞水平上揭示细胞内整体水平的基因表达状态和基因结构信息,帮助理解其基因型和表型之间的相互关系。...展开更多 Traditional animal transcriptome research mainly involves transcriptome sequencing at the organ or tissue level,ignoring the genetic specificity of individual cells.scRNA-seq can ...