scNT-seq是基于高通量和UMI的scRNA-seq方法,结合了代谢RNA标记,液滴微流和化学诱导4sU转为胞嘧啶类似物来同时测量同一个细胞内的新老RNA。 scNT-seq主要包括以下步骤: (1) 4sU对细胞的代谢标记;(2 - 3) 同时封装单个细胞以及带有条形码的oligo(dT)引物包覆珠到一个纳米级液滴里;(4)在液滴里进行4sU化学...
scNT-seq具体技术流程如下:首先将4sU添加到培养基中用来标记细胞中新生成的mRNA(图1第1步)。为了在单细胞转录组中区分含有4sU标记的转录本,将4sU化学转化反应整合到液滴微流控 (Drop-seq) 流程中(图1第2-4步)。 由于捕获mRNA的barcoded beads具有区分不同转录本的UMI序列,相比较没有UMI的单细胞分析技术(e...
scNT-seq具体技术流程如下:首先将4sU添加到培养基中用来标记细胞中新生成的mRNA(图1第1步)。为了在单细胞转录组中区分含有4sU标记的转录本,将4sU化学转化反应整合到液滴微流控 (Drop-seq) 流程中(图1第2-4步)。 由于捕获mRNA的barcoded beads具有区分不同转录本的UMI序列,相比较没有UMI的单细胞分析技术(e...
scNT-seq具体技术流程如下:首先将4sU添加到培养基中用来标记细胞中新生成的mRNA(图1第1步)。为了在单细胞转录组中区分含有4sU标记的转录本,将4sU化学转化反应整合到液滴微流控(Drop-seq)【2】流程中(图1第2-4步)。由于捕获mRNA...
scNT-seq具体技术流程如下:首先将4sU添加到培养基中用来标记细胞中新生成的mRNA(图1第1步)。为了在单细胞转录组中区分含有4sU标记的转录本,将4sU化学转化反应整合到液滴微流控 (Drop-seq) 流程中(图1第2-4步)。 由于捕获mRNA的barcoded beads具有区分不同转录本的UMI序列,相比较没有UMI的单细胞分析技术(e...
scNT-seq是基于高通量和UMI的scRNA-seq方法,结合了代谢RNA标记,液滴微流和化学诱导4sU转为胞嘧啶类似物来同时测量同一个细胞内的新老RNA。 scNT-seq主要包括以下步骤: (1) 4sU对细胞的代谢标记;(2 - 3) 同时封装单个细胞以及带有条形码的oligo(dT)引物包覆珠到一个纳米级液滴里;(4)在液滴里进行4sU化学...
scNT-seq a high-throughput and UMI-based scRNA-seq method 结合RNA代谢标记,微流控,将 4sU 重新编码为胞嘧啶类似物,以同时测量来自同一细胞的新旧转录组 对细胞 RNA 动力学进行时间分辨分析 Result Development and validation of scNT-seq. 1.通过4sU代谢标记,4sU会在转录过程中替换U的角色,但凡在标记后新...
scNT-seq是基于高通量和UMI的scRNA-seq方法，结合了代谢RNA标记，液滴微流和化学诱导4sU转为胞嘧啶类似物来同时测量同一个细胞内的新老RNA。scNT-seq主要包括以下步骤：(1) 4sU对细胞的代谢标记;(2 - 3) 同时封装单个细胞以及带有条形码的oligo(dT)引物包覆珠到一个纳米级液滴里;(4)在液滴里...
为了克服这些限制,美国宾夕法尼亚大学吴浩实验室开发了单细胞代谢标记新RNA标记测序(scNT-seq),这是一种高通量、基于UMI的scRNA-seq方法,用于检测单细胞mRNA的动态变化。 在细胞命运转化和响应外界信号的过程中,细胞类型特异性基因表达会发生变化,RNA水平的动态变化受到RNA转录、加工和降解相互作用的调控。在具有多种...
Finally, integrating scNT-seq with genetic perturbation identifies DNA methylcytosine dioxygenase as an epigenetic barrier into the 2C-like cell state. Time-resolved single-cell transcriptomic analysis thus opens new lines of inquiry regarding cell-type-specific RNA regulatory mechanisms....