结果发现,scGRO-seq检测到组蛋白位点体中复制依赖性组蛋白基因的活性转录,并且可对S 期细胞进行分类(图3a),通过不同细胞周期期特异性基因表达的分层聚类揭示单个细胞的三个重要簇,三个簇具有不同的细胞比例代表细胞不同周期阶段的长度(图3b),不同细胞周期转录水平存在差异(图3c)。
通过scGRO-seq技术,可以深入了解增强子和基因之间的协调关系,有助于揭示基因调控的复杂机制。 scGRO-seq能够精确估计单细胞内转录爆发的大小和频率,并揭示基因和增强子的共转录网络。该技术通过量化新生RNA和RNA聚合酶,提供了对单个细胞内转录活动的详细描述,揭示了功能相关基因的共同转录模式,有助于理解基因组的动态...
scGRO-seq 可以通过直接量化单个细胞中转录的 RNA 聚合酶来估计突发大小和频率,并可以利用复制依赖性非多聚腺苷酸化组蛋白基因转录来阐明细胞周期动力学。 scGRO-seq 的单核苷酸空间和时间分辨率使增强子和基因网络的鉴定成为可能。我们的结果表明,超级增强子的转录爆发先于相关基因的爆发。通过传授对全局转录的动态性质...
而scGRO-seq能够解决传统scRNA-seq存在的问题,作者利用scGRO-seq对小鼠胚胎干细胞进行实验,结果发现,scGRO-seq检测到组蛋白位点体中复制依赖性组蛋白基因的活性转录,并且可对S 期细胞进行分类(图3a),通过不同细胞周期期特异性基因表达的分层聚类揭示单个细胞的三个重要簇,三个簇具有不同的细胞比例代表细胞不同周期...
大家好,今天跟大家分享一篇2024年6月5日,来自麻省理工学院的Phillip A. Sharp研究团队在Nature期刊上发表一篇 Single-cell nascent RNA sequ encing unveils coordinated global trans cription 的研究文章,文中介绍了一种新型单细胞新生RNA测序方法(scGRO-seq),通过点击化学(click chemistry)定量评估单个细胞的全基因...
大家好,今天跟大家分享2024年6月5日,来自麻省理工学院的Phillip A. Sharp研究团队在Nature期刊上发表一篇Single-cell nascent RNA sequen cing unveils coordinated global transcr iption 的研究文章,文中介绍了一种新型单细胞新生RNA测序方法(scGRO-seq),通过点击化学(click chemistry)定量评估单个细胞的全基因组新生...
大家好,今天跟大家分享一篇2024年6月5日,来自麻省理工学院的Phillip A. Sharp研究团队在Nature期刊上发表一篇 Single-cell nascent RNA sequ encing unveils coordinated global trans cription 的研究文章,文中介绍了一种新型单细胞新生RNA测序方法(scGRO-seq),通过点击化学(click chemistry)定量评估单个细胞的全基因...