综上,该研究发展了一种单细胞多组学方法scRICA-seq,在单细胞水平实现了表观遗传学、RNA转录和剪接的整合分析,能够全面分析了染色质可及性、RNA表达和差异异构体选择之间的相关性。利用scRICA-seq,检测到了视网膜祖细胞(RPC)、视网膜神经元、感光细胞前体以及其他视网膜相关细胞类型的特异性基因和异构体表达模式,为进...
对模拟菌群进行分选实验,结果表明,通过 16S PCR 产物的 Sanger 测序,所有 MDA 阳性细胞均为大肠杆菌特异性 16S rDNA 序列,SAG 的基因组完整性在 19.12% - 99.76% 之间,平均映射率为 35.21% - 47.53%,成功率在 40% - 70% 之间 ,空液滴作为阴性对照未检测到阳性结果,进一步支持了 FISH-scRACS-seq 的高特...
研究者将scRICA-seq应用于人类视网膜发育过程,构建了人类视网膜类器官的单细胞多组学图谱。基于单细胞异构体的聚类分析,确定了六个细胞簇,对应于六种典型的视网膜早期神经元,包括视网膜祖细胞(RPCs)、视网膜神经节细胞(RGCs)、无长突细胞/水平细胞(AC/HCs)、视锥细胞前体(PR precursors)、神经生成RPCs(neurogenic RPC...
However, none of the few existing read simulators aim to mimic real data. Here, the authors introduce scReadSim, a single-cell RNA-seq and ATAC-seq read simulator that works by mimicking real data.Yan, GuanaoSong, DongyuanLi, Jingyi JessicaNature Communications...
scReadSim, a single-cell RNA-seq and ATAC-seq read simulator that allows user-specified ground truths and generates synthetic sequencing reads (in a FASTQ or BAM file) by mimicking real data. At both read-sequence and read-count levels, scReadSim mimics real scRNA-seq and scATAC-seq data....
(1) The scRCAT-seq read distribution; (2) Location of the motifs which were associated with real TSSs/TESs around the peaks; (3) Sequence motifs possibly resulting in false-positive TSS/TES, such as the internal priming sites (see “Methods”) (Supplementary Table1). We implemented four ...
作家ScrseQ的作家主页 作家ScrseQ1 作品数 4120 创作字数 1 创作天数 火热连载0书友 陆玄修仙传 来阅文旗下网站阅读我的更多作品吧! 第二章 灵根测试 仙侠 4120 全部作品 2025 - 至今 陆玄修仙传 来阅文旗下网站阅读我的更多作品吧! 登录后获得更多特色功能· 立即登录 ...
这篇文章通过对不同发育阶段的拟南芥根细胞进行scRNA-seq,构建了首个十万级水平的根细胞基因时空表达图谱,并利用最优传输理论(OT)推断出了细胞系的发育轨迹。同时,通过比较 scr 和 shr 突变体的scRNA-seq数据,从单细胞水平阐释了 scr 突变层细胞同时具有皮层和内皮层混合特性,并指出了其发育轨迹上的特性转变。最后...
At the same time, it can also convert NO into NO2 for passive regeneration of downstream catalyst particle trap (CDPF) and improve NOx conversion efficiency of SCR. Depending on the emission requirements, it is sometimes necessar...
1. Why single-cell RNA-seq 在人类组织中,细胞类型、状态和相互作用的多样性令人难以置信。为了更好地了解这些组织和现有的细胞类型,单细胞RNA-seq(scRNA-seq)提供了在单个细胞水平上表达基因类型的视角。 Image credit: courtesy of Dr. Ayshwarya Subramanian ...