目前复杂疾病研究方法热点之一就是多组学多方法的结合,近来多种新的结合方法中,scDRS是比较有代表性的将基因组学与单细胞测序的结合的方法,类似的方法还有sc-linker,SCAVENGE等,这类方法也属于一个新的交叉领域单细胞遗传学(Single-cell Genetics)。 传统的基因组学与单细胞测序的结合的方法,例如MAGMA或是LDSC-SEG...
scDRS将疾病GWAS和scRNA-seq数据集作为输入,输出细胞与疾病相关性 p 值。主要计算过程如下: scDRS 选择前 1000 个 MAGMA 基因,从 GWAS 汇总统计数据中构建一组推定的疾病相关基因集;软件假设这些设定的疾病基因在疾病关联细胞群体中具有更高的表达水平。 scDRS 计算每个细胞的原始疾病评分,量化该细胞中推定疾病基因...
scDRS_BC_norm_score<-c(scDRS_BC_norm_score,temp) } mdata$scDRS_BC_norm_score<-scDRS_BC_norm_score msub<-subset(mdata,scDRS_BC_norm_score!="NA") library(ggraph) library(ggplot2) msub$scDRS_BC_norm_score<-as.numeric(msub$scDRS_BC_norm_score) ggplot(data.frame(msub@meta.data,...
scDRS,单细胞疾病相关分数,采用与多基因分风险分数PRS类似的方法构建,但对象为细胞,而不是个体,旨在评估细胞高表达疾病相关基因的情况。scDRS与传统方法LDSC、MAGMA相比,能检验细胞类型相关性及同一细胞类型内的异质性。通过热力图展示表型与细胞类型关联结果,识别显著相关及异质性细胞亚群。在自身免疫...
Single-cell disease relevance score (scDRS). Contribute to martinjzhang/scDRS development by creating an account on GitHub.
《真人实拍女处被破的免费视频》蓝光完整版在线播放,真人实拍女处被破的免费视频剧情:他们在做什么柳青鸿怎么觉得他们前进的方向有点眼熟走了一下神给了一旁的黑衣人可乘之机黑色带着血腥气的光芒兜头打下柳青鸿心下一惊手下也不慢指诀一捏青光耀眼...至于里面是
python3 ~/scDRS/bin/scdrs compute-score \ --h5ad_file ${h5ad_file}\ --h5ad_species human\ --gs_file ${gs_file}\ --gs_species human\ --flag_filter True\ --flag_raw_count False\ --n_ctrl 1000\ --flag_return_ctrl_raw_score False\ --flag_return_ctrl_norm_score True\ --...
说到中性笔,大概是很多人学生时代的记忆,像什么晨光,真彩,三菱,百乐这些中性笔品牌很多人都能如数家珍。而12月20日,小米上线了小米巨能写中性笔 10支装,价格则只要9.9元。 小米巨能写中性笔采用直注式储墨设计,笔杆就是笔芯。采用日本MIKUNI油墨,画线距离大概是1600米,书写的话大约5万字。比普通中性笔要多出大...
亲亲我的小宝贝【转发】@KTBERRY:金泰亨超话防弹少年团金泰亨超话 宝贝那时候很累了 很久都没有休息过手都在抖😢(但是你看他直拍 泰亨的表情完全看不出来他原来这么累! O网页链接
血清scd36水平及cd36rs1049673基因多态性与早发冠心病的关系 系统标签: 冠心病基因多态性血清水平orcg基因型 天津医科大学硕士学位论文中文摘要目的:脂质代谢异常是动脉粥样硬化(AS)最重要的危险因素,目前已有大量证据表明清道夫受体sCD36与低密度脂蛋白胆固醇(LDL.c)代谢有关,sCD36也参与到游离脂肪酸、甘油三酯等脂质的...