3.9 分析疾病在不同细胞的表达水平差异 fortrait in["SCZ","Height"]: !scdrs perform-downstream\--h5ad-file single_cell_data/zeisel_2015/expr.h5ad\--score-file single_cell_data/cwy/{trait}.full_score.gz\--out-folder single_cell_data/cwy/\--group-analysis level1class\--flag-filter-data...
3.10 对疾病在不同细胞的表达水平差异进行可视化 dict_df_stats={trait:pd.read_csv(f"single_cell_data/cwy/{trait}.scdrs_group.level1class",sep="\t",index_col=0)fortraitin["SCZ","Height"]}dict_celltype_display_name={"pyramidal_CA1":"Pyramidal CA1","oligodendrocytes":"Oligodendrocyte","p...
1、scDRS的计算原理如下所示: 图片来源:Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data[R]. Nature Publishing Group, 2022. 2、通过scDRS分析可以得到什么 第一、鉴定表型相关的细胞类型,比如下图: 第二、...
1、scDRS的计算原理如下所示: 图片来源:Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enrichment distinguishes disease associations of individual cells in single-cell RNA-seq data[R]. Nature Publishing Group, 2022. 2、通过scDRS分析可以得到什么 第一、鉴定表型相关的细胞类型,比如下图: 第二、...