1. 相比常规BS-seq,scBS-seq在连接接头之前进行BS转化,这样就避免了连接接头之后的gDNA在BS转化过程中不必要的断裂损失。 2. scBS-seq在最开始使用随机引物进行了多轮随机PCR扩增,以此增加DNA产量,这个过程使得scBS文库已经不具有方向性。 显而易见,对于scBS-seq数据,比对参数应当按照非方向性文库来设置参数,而不...
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DNA methylation prediction on scBS-seq profiled mESCsPan, Gaofeng
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DNA methylation at cytosine is a major epigenetic mark, heavily implicated in controlling key cellular processes such as development and differentiation, cellular memory, or carcinogenesis. Bisulfite treatment in conjunction with next generation sequencing has been a powerful tool for studying this ...
The utilization of single-cell bisulfite sequencing (scBS-seq) methods allows for precise analysis of DNA methylation patterns at the individual cell level, enabling the identification of rare populations, revealing cell-specific epigenetic changes, and improving differential methylation analysis. Nonetheless...