Fig.2 The SARS-CoV-2 strains of regional distribution 与其他的β科罗纳病毒相似,SARS-CoV-2的基因组在5 '端有一个ORF1ab多聚蛋白和4种主要结构蛋白,即刺突表面糖蛋白、小包膜蛋白、基质蛋白和核衣壳蛋白。通过核酸序列比对分析发现,来自日本(爱知县)、美国(威斯康星州)和澳大利亚(维多利亚州)的SARS-CoV-2基...
MERS-CoV(约50%)的同源性,SARS-CoV-2全基因组与浙江舟山的两株蝙蝠样冠状病毒株Bat-SL-CoVZC45(同源性87.99%)和Bat-SL-CoVZXC21(同源性87.23%)进化关系更近,但SARS-CoV-2的进化分支长度更长,说明新病毒进化上更晚出现。
SARS-CoV-2 is an extremely contagious respiratory virus causing adult atypical pneumonia COVID-19 with severe acute respiratory syndrome (SARS). SARS-CoV-2 has a single-stranded, positive-sense RNA (+RNA) genome of ~ 29.9 kb and exhibits significant genetic shift from different isolates. Afte...
SARS-CoV-2 is an extremely contagious respiratory virus causing adult atypical pneumonia COVID-19 with severe acute respiratory syndrome (SARS). SARS-CoV-2 has a single-stranded, positive-sense RNA (+RNA) genome of ~29.9kb and exhibits significant genetic shift from different isolates. After ...
冠状病毒病2019 (新型冠状病毒肺炎) 由新型冠状病毒 (SARS-CoV-2) 引起,是中国湖北省2019年12月首次出现的一种新的传染病,被发现与武汉一个大型海鲜和动物市场有关。2020年1月12日,感染患者的气道上皮细胞被用来分离出一种名为新型冠状病毒的SARS-CoV-2,这是冠状病毒家族中第七个感染人类的成员。从感染患者获...
Since the first SARS-CoV-2 sequence was published in January 2020 (ref. 15), the unprecedented rate of genome data generation was far greater than any other pathogen16, with 4.8 million genomes deposited in Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) through 31 October 2021 (ref...
As the SARS-CoV-2 pandemic is rapidly progressing, the need for the development of an effective vaccine is critical. A promising approach for vaccine development is to generate, through codon pair deoptimization, an attenuated virus. This approach carries the advantage that it only requires limited...
SARS-CoV-2表面含有刺状糖蛋白,这是当前疫苗开发的主要目标,因为针对这种蛋白的抗体可以中和感染。公司和学术机构已开发出基于S糖蛋白及其抗原域和表位的疫苗,这些抗原域和表位已被证明能有效产生中和抗体。然而,新的SARS-CoV-2变种的出...
内容提示: 自2019年12月8日起,在中国武汉爆发了以呼吸道为主要症状的肺炎,经二代测序、病毒分离和鉴定等手段,确定为一种新型的冠状病毒[1-2],世界卫生组织于2020年1月19日将其暂命名为2019新型冠状病毒(2019Novel Coronavrius, 2019 nCoV)[3],于2020年2月11日正式命名为SARS-CoV-2病毒,引起的疾病称为2019...
手册中主要介绍了对SARS-CoV-2基因组序列的处理和分析,序列可以是从公共数据库下载或者是本地生成的数据。每个单独基因组序列被分成一系列子序列(从序列中提取多个部分序列),每一个序列会根据参考基因组进行SNP的分析。所有的SNP以开放的(动态)字符集存储,这些字符集