在NovaSeq 6000测序系统测序时,首先会对文库进行芯片制备,目的是将文库DNA(RNA)模板固定到芯片上,在固定DNA模板的过程中,每个DNA(RNA)分子会形成一个簇,一个簇就是一个测序位点,在进行固定过程中极少量的簇与簇之间物理位置会发生重叠,在测序时,测序软件通过前4个碱基对这些重叠的点进行分析和识别,将这些重叠点位...
1)总RNA提取 提取后的总RNA要进行纯度(purity)、浓度(quantity)、完整性(RIN)的质量检查。 不同样品的total RNA中mRNA含量差异较大,若total RNA起始投入量过低,不能保证有足够的mRNA用于后续建库,因此建议RNA起始量为1～4μg。 不同RIN(RNA intergrity number)示意图:(从1～10为bad to good) 由于不完整或降...
转录组测序（RNA-seq）的建库过程与原理主要包括实验设计和实际操作步骤。首先，根据研究目标选择合适的策略，如真核生物通常使用oligo dT磁珠富集mRNA，而研究lncRNA或原核生物转录组则需去除rRNA。考虑链特异性，有 stranded 和 un-stranded 两种选择。建库步骤详细如下：总RNA提取：检查纯度、浓度和完整性...
superqun原创 一、流程概括 RNA-seq的原始数据(raw data)的质量评估 linux环境和R语言... superqun阅读 16,826评论 11赞 67 mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipeline mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal! 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的... ZZZZZZ_XX阅读 7,...
00:00/00:00 易基因-转录组学和表观转录组学测序实验中的RNA提取步骤 深圳易基因科技发布于:广东省2023.10.08 14:51 分享到