今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的结...
本发明公开一种RNA结合蛋白与环状RNA的结合位点预测方法,其方法包括:先以多尺度的方式扩展网络中的浅层特征,再通过在进入递归神经网络之前对特征进行解码来扩展深层特征,然后将经过扩充后的深层和浅层特征进行融合后送入分类网络的全连接层进行分类,最后根据分类结果判断是否为结合位点,实现RNA结合蛋白与环状RNA的结合...
10.一种用于预测蛋白质-RNA相互作用结合位点的方法,包括: 步骤1、将待测的RNA转录本的序列中特定长度的子序列作为潜在的RNA结合蛋白的结 合位点,获得潜在的结合位点处及其上下游区域的序列数据,以及所述潜在结合位点及其 上下游区域的结构数据,将所述序列数据和结构数据输入通过权利要求1-7之一构建的针 对所述RNA...
蛋白质序列rna预测结合risp信息学 摘要论文题目:蛋自质序列中RNA结合位点的预测作者姓名:***姓名:**宏**授)学校名称:东南大学随着后基因组时代的到来,使用机器学习方法对生物数据进行数据挖掘已经成为生物学研究的一种新方法。本课题主要利用支持向量机方法,结合蛋白质序列的特征提取,实现在氨基酸残基的水平上对蛋白...
蛋白质分子中RNA结合位点的分析和预测-生物化学与分子生物学专业论文 目录中文摘要1 Abstract 5 第一章 前言9 1.1 实验方法9 1.1.1 X 射线晶体衍射 9 1.1.2 核磁共振10 1.1.3 其它结构测定方法10 1.2 生物信息学方法10 1.2.1 研究蛋白质中的 RNA 结合域 11 1.2.2 通过各种特征,采用统计分析或者机器学习...
基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站--RBPsuite发布于 2022-02-13 15:15 · 1.1 万次播放 赞同4添加评论 分享收藏喜欢 举报 深度学习(Deep Learning)核糖核酸(RNA) 写下你的评论... 暂无评论相关推荐 13:57 第28集-逆转家族遗传病,告别植物神经功能紊乱,还你健康人生! 王...
蛋白质RNA结合位点分析分析的位点的预测结合位点的分析与 分类号密级 UDC保密期限 博士学位论文 题目蛋白质分子中RNA结合位点的分析和预测 作者姓名** 指导教师李伍举研究员应晓敏副研究员 培养单位军事医学科学院基础医学研究所 专业名称生物化学与分子生物学 ...
.根据权利要求1所述的基于自注意力机制的RNA-蛋白质结合位点预测方法,其特征在于,所述步骤S1中,RNA与蛋白质结合位点数据来自于参考基因组对应的片段序列读取的峰值片段,该基因组位置与此处的RBP结合;将所有基因有结合位点的正样本序列随机组合,获取得到阴性结合位点数据,做为负数据集,该基因组位置与此处的RBP不结合...
第四处理模块,将要测试的数据输入结果分类器,通过各子模型的投票获取最终的预测结果。 本发明具有以下有益效果: 通过mRMR-IFS筛选特征,保留主要的影响特征,减少噪声特征对预测准确性的影响,显著提高了蛋白质RNA结合位点预测的准确性,解决了生物实验成本昂贵和实验周期长等问题。
摘要 本发明涉及一种预测蛋白质在RNA病毒基因中的结合位点的方法,用于获取RNA病毒基因序列被选为蛋白质结合位点的概率,该方法包括以下步骤:1)获取多条RNA病毒基因序列;2)以设定的单位长度对每条所述RNA病毒基因序列进行位点信息量计算并比较,获得最大位点信息量及该最大位点信息量所对应的位点信息,根据所述位点信息获...