今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的结...
RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的结合得分分布。对于线性RNA,RBPsuite使用iDeepS来预测它们与RBP的结合分数;对于环状RNA(circRNA),RBPsuite使用CRIP预测它们...
RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的结合得分分布。对于线性RNA,RBPsuite使用iDeepS来预测它们与RBP的结合分数;对于环状RNA(circRNA),RBPsuite使用CRIP预测它们与RBP的结合分数。 话不多说,上链接:http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/RBPsuite/,根据官网地址打开主页面如下。 RBPsuite...
今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA上的RBP结合位点。 RBPsuite首先将输入的RNA序列分割为101个核苷酸的片段,并对片段与RBP之间的相互作用进行评分。RBPsuite进一步检测结合片段上已验证的基序,从而给出沿全长序列的...
RNA结合蛋白(RBP)在各种生物学过程中都起着至关重要的作用,它们在RNA上的结合位点可以深入了解涉及RBPs的疾病背后的机制。因此,如何识别RNA上的RBP结合位点对于后续分析至关重要。今天,小编就给大家介绍一种基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站:RBPsuite,这是一个易于使用的网络服务器,用于预测线性和环形RNA...
RNARNA结合蛋白RNA-蛋白质结合位点深度学习RNA及RNA结合蛋白之间的相互作用在基因调控中扮演着重要角色.许多预测RNA-蛋白质结合位点的深度学习方法陆续提出.目前多数研究没有将RNA结合蛋白作为模型输入,限制了深度学习模型的规模.对此问题,提出一个带有RNA结合蛋白输入的深度学习模型,通过扩大训练集的规模挖掘RNA-蛋白质结合...
基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站--RBPsuite发布于 2022-02-13 15:15 · 1.1 万次播放 赞同4添加评论 分享收藏喜欢 举报 深度学习(Deep Learning)核糖核酸(RNA) 写下你的评论... 暂无评论相关推荐 4:31 手握长剑严阵以待!央视节目《淬火》中,展示福建舰电磁弹射细节 大...
在新建立的RNA结合位点预测模型的基础上,我们结合计算机网络技术,开发了RISP在线预测系统(http://grc.seu edu.cn/dsp)。用户在预测系统输入界面输入任意一条蛋白质序列,就可以得到蛋白质序列上的RNA结合位点的预测结果返回。除了以‘+’或‘.’的形式来对蛋白质序列中每一个氨基酸残基是否是RNA结合位点进行标记之外...
第四处理模块,将要测试的数据输入结果分类器,通过各子模型的投票获取最终的预测结果。 本发明具有以下有益效果: 通过mRMR-IFS筛选特征,保留主要的影响特征,减少噪声特征对预测准确性的影响,显著提高了蛋白质RNA结合位点预测的准确性,解决了生物实验成本昂贵和实验周期长等问题。
摘要 本发明涉及一种预测蛋白质在RNA病毒基因中的结合位点的方法,用于获取RNA病毒基因序列被选为蛋白质结合位点的概率,该方法包括以下步骤:1)获取多条RNA病毒基因序列;2)以设定的单位长度对每条所述RNA病毒基因序列进行位点信息量计算并比较,获得最大位点信息量及该最大位点信息量所对应的位点信息,根据所述位点信息获...