热图说明: 1)由于pheatmap参数众多,这里仅设置了一些常用的参数 2)颜色默认是红白蓝,可以根据喜好设置成红黑绿等颜色 3)参数“要显示的名字”可以控制是否显示基因名或者样品名。一般来说,当基因数少于50个时可以显示基因名;当样品数小于20个时,可以显示样品名。否则图的文字会重叠,不美观。 4)默认在所有样品中值...
#在原来的dataframe里加一列,列名是trend;然后再加一列,列名是rank,把矩阵里的基因按照log2 fold change的排列分别加上编号“1,2,3...”;最后再加一列,列名是hits,这一列先都赋值为“medium” > P_vs_Q <- data.frame(P_vs_Q,'trend'=up_or_down,'rank'=1:nrow(P_vs_Q),'hits'='medium',st...
转录组测序(RNA-seq)分析 DLab实验室 RNA-seq分析之如何用R中的ggplot可视化基因表达数据火山图 小云爱生信 10400 单细胞RNA-seq分析教程【一】测序原理 Timo的生信笔记 61730 03:22 11. Kaplan–Meier 生存分析 生信幻想家 1.1万1 10:34 kegg通路分析 ...
1)由于pheatmap参数众多,这里仅设置了一些常用的参数 2)颜色默认是红白蓝,可以根据喜好设置成红黑绿等颜色 3)参数“要显示的名字”可以控制是否显示基因名或者样品名。一般来说,当基因数少于50个时可以显示基因名;当样品数小于20 个时,可以显示样品名。否则图的文字会重叠,不美观。 4)默认在所有样品中值一样的整...
热图说明: 1)由于pheatmap参数众多,这里仅设置了一些常用的参数 2)颜色默认是红白蓝,可以根据喜好设置成红黑绿等颜色 3)参数“要显示的名字”可以控制是否显示基因名或者样品名。一般来说,当基因数少于50个时可以显示基因名;当样品数小于20 个时,可以显示样品名。否则图的文字会重叠,不美观。
热图说明: 1)由于pheatmap参数众多,这里仅设置了一些常用的参数 2)颜色默认是红白蓝,可以根据喜好设置成红黑绿等颜色 3)参数“要显示的名字”可以控制是否显示基因名或者样品名。一般来说,当基因数少于50个时可以显示基因名;当样品数小于20 个时,可以显示样品名。否则图的文字会重叠,不美观。
热图说明: 1)由于pheatmap参数众多,这里仅设置了一些常用的参数 2)颜色默认是红白蓝,可以根据喜好设置成红黑绿等颜色 3)参数“要显示的名字”可以控制是否显示基因名或者样品名。一般来说,当基因数少于50个时可以显示基因名;当样品数小于20 个时,可以显示样品名。否则图的文字会重叠,不美观。