易基因: WGBS+RNA-seq揭示黄瓜作物的“源-库”关系受DNA甲基化调控|项目文章 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 作物产量取决于库(sink,获得同化物)的潜力和源(source,供给同化物)的能力,“源—库”关系的优化对作物产量调控具有重要意义。黄瓜(Cucumis sativus L.)是世界范围内广泛
易基因: WGBS+RNA-seq揭示黄瓜作物的“源-库”关系受DNA甲基化调控|项目文章 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 作物产量取决于库(sink,获得同化物)的潜力和源(source,供给同化物)的能力,“源—库”关系的优化对作物产量调控具有重要意义。黄瓜(Cucumis sativus L.)是世界范围内广...
首先我们来看一下这篇文章讲述了什么。 《在分析人类群体样本时,热门的差异表达方法夸大了假阳性》 作者在使用大量人类RNA-seq样本在两个条件之间寻找差异表达基因时,通过置换(permutation)分析发现热门的生信软件DESeq2和edgeR的假阳性率高得出乎意料。此外作者还测试了limma-voom、NOISeq、dearseq和Wilcoxon秩和检验,...
图9. cFAM124A是K-80003增加PDAC AG敏感性的潜在生物标志物 最后,基迪奥生物是定制化组学测序与生物信息分析服务领域的领先者,公司组学服务涉及单细胞组学、空间组学、翻译组、基因组等40条业务线,特别在多组学联合分析方面有丰富的项目经验和大量的客户文章案例,欢迎留言咨询!
有句调侃的话叫“唯有套路得人心”,在科学研究中也存在一些套路,这些所谓的套路大多是科研的逻辑性和严谨性的体现。今天我从近期的一篇Nature文章谈用RNAseq研究分子机理的“套路”。 RNAseq是把mRNA和Non-codingRNA等用高通量测序技术把它们的序列测出来,并可计算出其丰度,其中最常用的是mRNA测序,检测所有基因的转...
牛膝是治疗骨质疏松症的著名中药。多糖是形成肠道微生物群的主要因素,是双棱草的主要成分。然而,双歧杆菌多糖对人体肠道菌群的生物活性尚不清楚。本文从苦参中提取并纯化了平均分子量为93.085 kDa的果胶多糖A23-1。A23-1由鼠李糖、葡萄糖醛酸、半乳糖醛酸、葡萄糖、半乳糖和阿拉伯糖组成。GC-MS、部分酸水解和NMR结...
这篇文章利用10×scRNA-seq数据获得内皮细胞的标记基因,结合bulk RNA-seq数据并利用WGCNA分析构建了GBM的预后模型+分子亚型。虽然整体内容没有脱离常规预后模型分析套路,但用上“内皮细胞”这一切入点后,身价倍增,毫不逊色,发到 4.5分+绝对名副其实!内皮细胞目前的生信发文量还不多,属于黄金抢发期!超高性价比,感...
rna-seq的生信文章 RNA-seq(RNA测序)是一种用于研究转录组的高通量测序技术,它在生物信息学领域引起了广泛的关注。RNA-seq技术利用高通量测序平台对细胞或组织中的RNA进行测序,从而可以获得关于基因表达水平、可变剪接、转录本结构等信息。因此,RNA-seq在生物医学研究中扮演着重要的角色。 关于RNA-seq的生物信息学...
Here we demonstrate that the large language model GPT-4 can accurately annotate cell types using marker gene information in single-cell RNA sequencing analysis. When evaluated across hundreds of tissue and cell types, GPT-4 generates cell type annotations exhibiting strong concordance with manual annot...