基本概念 RNA-seq：基于二代测序技术，研究特定细胞在某一功能状态下所有RNA的功能，主要包括mRNA和非编码RNA。能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。Q20,Q30：Phred 数值大于20、30的碱基占总体碱基的百分比，其中Phred=-...
SAM 的全称是Sequence Alignment/Map format。而 BAM 就是SAM 的二进制文件(B 取自binary) 。 表达定量相关 TPM :一种表达量归一化方法,主要用于small RNA 分析项目: TPMgene(i) = 10 *readcount9 gene(i) /Libsizegene TMM :一种标准化方法,具体算法: 通常,Mg 值30%,Ag 值5% 。在我们的无重复差异...
RNA-seq文库及其构建方法.pdf,本发明公开了一种RNA‑seq文库及其构建方法,可以降低构建RNA‑seq文库的成本。其中,RNA‑seq文库的构建方法,包括:将质粒文库感染受体细胞,得到转染细胞;从转染细胞中提取第一总RNA;用质粒探针标记处理第一总RNA中的质粒文库mRNA,
5、质粒文库的构建具体可以按照以下方式实现:将目标研究区域(包括全基因组、目标捕获区域、开放染色质区等)的dna(英文全称为deoxyribonucleic acid,中文为脱氧核糖核酸)片段同源重组至starr-seq载体上,同源重组产物经过质粒纯化,通过电转的方式进行高效率转化,随后进行摇菌和质粒抽提,得到目的重组质粒,对其进行建库和测序,...
脾的载菌量77 4.3.4 牛结核病分子标志物验证77 4.4 小结与讨论79 第五章 结论82 参考文献83 致谢96 作者简历97 VI 主要符号对照表 英文缩写 英文全称 中文名称 bp Base pair 碱基对 bTB Bovine tuberculosis 牛结核病 CFU Colony-Forming Unit 菌落形成单位 DNA Deoxyribonucleoside acid 脱氧核糖核酸 DTH ...
标题(英文):Integrating WES and RNA-Seq Data For Short Variant Discovery 标题(中文):整合 WES 和 RNA-Seq 数据以进行短变异发现 发表期刊:(预印版暂无期刊) 作者单位:Sequentia 生物技术有限公司 发表年份:2021 文章地址:https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-847277/v1 ...
基本概念 RNA-seq：基于二代测序技术，研究特定细胞在某一功能状态下所有RNA的功能，主要包括mRNA和非编码RNA。能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。Q20,Q30：Phred 数值大于20、30的碱基占总体碱基的百分比，其中Phred=-...