单细胞数据的差异基因表达分析几乎总是随后进行基因集富集分析,其目的是识别与实验条件相比在实验条件下过度表达的基因程序,例如生物过程、基因本体或调控通路。基于差异表达(DE)基因的对照或其他条件。 为了确定两种条件之间以细胞类型特异性方式富集的通路,首先选择基因集特征的相关集合,其中每个基因集定义一个生物过程(...
我们在做通路富集分析的时候,会有这么一个问题:我们可以利用GSEA rank图来观察基因集富集在上调还是下调的基因表达位置,但是除了NES,我们可不可以明显地去定量一个通路在某个样本中的值呢?(这个值代表该通路在样本中处于激活还是抑制)。可不可以根据该分数来进行生存分析呢?答案是可以的。我们通过这样的思路,有个原...
KEGG之代谢通路分析 博莱克代谢组学 2.5万2 18:26 RNA-seq原理介绍 beryyyyyyy 4.1万262 14:58 代谢物通路富集分析(KEGG) mu蝴蝶 10:49 9.2 GO,KEGG富集分析数据可视化气泡图(微生信) 药学生阿程 04:11 【简介区免费领课】【生信分析-15】GO+KEGG结果怎么看?图片怎么摆?