RNA-seq报告解读, 视频播放量 1621、弹幕量 1、点赞数 55、投硬币枚数 17、收藏人数 239、转发人数 20, 视频作者 吉凯基因, 作者简介 吉凯基因B站唯一官方号,您的科研小助手,相关视频:全基因组测序WGS报告解读,WGBS分析demo报告解读,KEGG通路注释与富集分析,circRNA-s
meRIP-seq报告解读 42:10 miRNA-seq报告解读 28:25 RNA-seq报告解读 01:17:19 RRBS分析demo报告解读 21:09 WGBS分析demo报告解读 49:17 WGCNA分析 10:37 全基因组测序WGS报告解读 34:20 全外显子测序WES报告解读 24:14 cellxgene操作演示 06:59 单细胞 V(D)J 多样本联合分析报告解读 51:...
可能细心的小伙伴们发现了,我们的RNA-seq在线报告针对以上的问题,又进行了新的一轮升级! 将功能富集分析部分独立成单独的版块,对富集分析的功能增加了各种类型的统计图、实现了更丰富的交互式图表分析,为用户带来更完美的产品体验,生成的图表可以直接用于文章,助力客户的数据个性化分析与文章发表!下面就来看看本次的升...
而RNA-seq在线报告中,系统已经上传好项目的序列数据库了,不需要用户自己上传,这就简化了一步,操作起来更简单快捷; 2)比较实际的一点,omicsharetools里的blast工具需要花费奥币,而RNA-seq在线报告不需要奥币!在基迪奥完成的每个RNA-seq项目,都会自动生成一份在线报告。 下面我们来看一下blast分析功能的页面以及操作步骤。
这一次我们首先了解RNA-seq的分析流程 总的来说,各种有参组学分析要点大同小异,利用主流分析软件结合数据库来解释分析结果。一份报告可以出近百张花花绿绿的figures,我们先看看大致内容。 标配内容:(不可能没有的) 测序数据的一些统计及过滤 比对情况的说明及统计 ...
R2=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_2.fastq.gz fastqc $R1 $R2 这步会产生一个html文件,这就是fastqc的结果,我们可以双击在网页中打开进行查看。(详见下面介绍的fastqc报告解读) 2.png fastp 用于数据过滤 3.png fastp -i $R1 -I $R2 -o ../02clean/SRR15859344_1.clean.fastq.gz -...
根据基因组可以将病毒分为:环状DNA、线性DNA、线性有polyA RNA、 线状无polyA RNA和环状RNA。 三代测序在这里的优势:测全长、无需组装。 组装:unicycler(二代或二代+三代)、flye(三代)。 注释:prokka、prodigal 。 绘图:circos 。 线粒体、叶绿的组装注释 ...
项目名称:(RNA-seq)转录组测序及分析报告 所属分类:生物信息学分析-报告解读 联系电话:020-85625352 QQ:386244141 Email:servers@gzscbio.com 技术服务描述 转录组测序及分析报告 生信部 2021年03月19日 项目信息 合同编号:xx-xx-202x-xx-xx 客户姓名:xxx 客户单位:xxxxxx 1. 分析流程 1.1. 建库测序流程...
本发明公开了一种基于云计算的RNAseq在线报告流程分析方法及系统,该方法包括:步骤S1,提供用户上传数据的操作;步骤S2,根据用户数据上传的操作自动链接从云服务器中获取用户上传的对应项目的测序原始数据,并提供用户设置流程分析设置信息;步骤S3,获取用户选择的测序原始数据以及设置的流程分析设置信息,通过对流程分析设置信息...
专利摘要:本发明涉及二代测序生信解读技术领域,尤其涉及基于RNA‑seq数据分析、变异评级和报告生成系统及方法,包括自动获取数据和质控管理;自动分析生成SnvIndel变异、融合基因、基因表达结果数据;生成SnvIndel变异,融合基因的变异注释与过滤;对SnvIndel变异位点、融合基因评级管理,加快了判级的效率;临床意义调用模块化匹配...