MiRNA-Target:该模块主要是预测与miRNA结合的靶基因,以及两者的结合位点。 Degradome-RNA:该模块专门用于分析RNA的降解模式,主要是针对miRNA介导的降解片段进行测序,从而筛选和鉴定miRNA调控的靶基因。 RNA-RNA:该模块主要预测候选ncRNA及其靶标之间的RNA-RNA相互作用。 ceRNA-Network:本模块提供3个子模块,即mRNA-ceRNA...
LncRNA(Long non-coding RNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。LncRNAs作用范围广泛,机制非常复杂,可以与DNA、RNA、蛋白质互作,参与表观、转录、转录后等多个层面的调控,在生命活动中有重要作用。LncRNA可以与miRNA互作,作为ceRNA并吸收miRNA,抑制miRNA的作用,促进mRNA表达。常见的靶基因预测网站TargetScan、microRNA等...
这个RNA与蛋白互作 不是测定分子间相互作用力吗 我们用仪器检测 亲和力大小强弱 预测的网站 不准吧~ bright8 有分子互做仪,直接测出来就好啦。 muchong5577 看看这个是否对你有帮助咯:http://swissmodel.expasy.org 根本扛不住 http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_omics_group 这个网站,比较常用的一...
这个网站,比较常用的一个RNA与蛋白质互作的网站 http://pridb.gdcb.iastate.edu/RPISeq/ 这个预测特定...
第一章讲的就是植物lncRNA-蛋白质相互作用的研究背景和现状,15-16页有个表简述了目前用到的数据库 ...
Starbase是一个专注于RNA互作组的数据库,提供了miRNA靶标、RNA-RNA相互作用、ceRNA调控网络和RNA与蛋白结合信息等多种数据类型。 进入官网(http://starbase.sysu.edu.cn/),主页如下所示,最上方菜单栏中包含以下模块。 MiRNA-Target:该模块主要是预测与miRNA结合的靶基因,以及两者的结合位点。