RNA-seq检测对血液肿瘤患者的临床意义 01 助力精准分型 上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室Li等人发起过一项大规模的国际研究,研究纳入了1223例B细胞前体急性淋巴母细胞白血病(BCP ALL)患者,使用RNA-seq重新分析和描绘了患者的转录组结构,共鉴定了14...
在血液肿瘤的研究与诊疗领域,可以利用RNA-seq测序全面了解患者融合基因的情况,也可使用靶向RNA测序(tRNA-seq)针对特定基因或基因集合的转录本进行测序,为转录本检测和定量提供高灵敏度分析,辅助临床进行诊断、病因探寻、预后评估、用药指导,以及寻找微小残留病(MRD)监测分子标志物,建立适合患者的精准治疗方案,避免治疗不...
RNA-seq在ALL中的应用可拓展到AML和其他血液系统肿瘤。 RNA-seq可检测AML相关的基因融合,基因突变和表达,全面对AML患者进行分型,预后分层和治疗指导。 RNA-seq在基因突变检测中也有较高的准确性 5 血液肿瘤融合基因转录组测序项目 本项目采用RNA-seq技术,依据血液肿瘤WHO疾...
近几年，高博医学（血液病）北京研究中心北京高博博仁医院采用了肿瘤转录组测序分析（RNA seq）检测技术，发现了很多罕见的肿瘤融合基因形式，为临床医生在临床诊疗工作中提供了极其重要的信息，有力指导了对肿瘤病人的精准诊断和治疗，提高了病人的生存和获益。下面就分享一例，RNA seq检测提供重要预后因素的病例。基本...
TST代表肿瘤新抗原的来源 细胞外囊泡中的RNA剪接连接用于癌症诊断 03 团队对来自4种不同体液的1,128个样本，进行了EV RNA-seq分析。团队在EV中鉴定了472,193个线性剪接位点和121,816个反向剪接位点。在线剪接位点中，249,701个常见于癌组织、正常组织和EV。EV中RNA剪接连接的基因组分布，与癌组织中的基因组分布...
组会上同学分享了一篇实验生物学文章,有趣的是里面用到了RNA-seq,而且数据量不行,不过分析的点非常少,由此可以说明RNA-seq技术的常规化了。 背景介绍 多发性骨髓瘤(Multiple Myeloma,MM) 骨髓瘤又称浆细胞瘤,有多种类型,其中多发性骨髓瘤(Multiple Myeloma,MM)最为常见。 多发性骨髓瘤(MM)是B细胞恶性肿瘤,它...
单细胞技术对科学家研究人类健康和疾病的方式产生了巨大的影响对CAR T细胞治疗血液肿瘤的效果(1)认知功能障碍的机制(2)糖尿病肾病的治疗(3)在过去十年中,单细胞RNA测序是非常常用的分析技术(4)而我们仍面临着一些挑战 我们前方的道路将是什么样的? 总的来说,单细胞转录组学的使用伴随着样本存储运输方面的障碍,最...
循环肿瘤细胞(CTCs)是HCC中肝内和肝外转移的“种子”。在传播过程中,CTCs会受到血液微环境的影响,因此,针对性地研究CTCs及其在血液扩散过程中的变化,有助于发现肿瘤转移的新机制,为发展更有效的肝癌抗转移治疗策略提供了可能。 研究方法和结果 1. scRNA-seq分析血管4位点CTCs 图1b为CTC与白细胞(white blood ...
原名:Dissecting spatial heterogeneity and the immuneevasion mechanism of CTCs by single-cell RNA-seq in hepatocellular carcinoma 译名:单细胞RNA-seq分析肝癌中循环肿瘤细胞的空间异质性及免疫逃避机制 期刊:Nature Communications IF:14.919 发表时间:2021年7月 通讯作者:侯勇,樊嘉,杨欣荣 通讯作者单位:复旦大学 DO...
2020年2月10日发表于Nature Medicine杂志的文章应用强大的单细胞RNA-seq技术揭示了CD8+ T细胞可以作为转移性黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂治疗药物持续应答的血液标志物。 背景: 通常免疫检查点阻滞剂(ICB)的敏感性是由肿瘤属性决定的,即可以根据肿瘤负载、淋巴细胞浸润等肿瘤特征获知ICB治疗的敏感性、推测肿瘤免疫治...