前排提醒:scRNA-seq的详细分析已经在我的新的文章里单独拿出来讲了,感兴趣的可以去看一看～ 笔者是中国科学技术大学的一名生物大三本科生,同时也是iGEM USTC software的队长。这段时间在学习生物信息学的工作流…
一般来说,我们做RNA-Seq的假设是基于: 某一个条件影响了表型 --> 假设,表型是由蛋白的变化引起的 --> 假设,蛋白的变化大概率是由对应gene表达量的改变引起的 --> 因此,需要对gene进行定量 --> 最终,进行RNA-Seq 2.1 polyA + 建库策略 也正是因为上述的推理过程,我们才需要去做RNA-Seq对全转录组进行gene...
▪【RNA-seq技术简介】：1.RNA-seq是一种高通量测序技术，通过测序RNA分子来研究基因表达水平和转录本结构。2.该技术可以提供关于细胞内基因表达差异、突变、剪接变异等信息，并被广泛应用于基础生物学、临床医学、农业科学等领域。3.RNA-seq数据的生物信息学分析包括质量控制、比对、定量、差异表达分析等步骤，需要...
RNA-seq 生物信息学 热图 火山图 KEGG富集分析 61 0 2025-02-22 21:06:44 未经作者授权,禁止转载 您当前的浏览器不支持 HTML5 播放器 请更换浏览器再试试哦~4 2 6 分享 - 知识 校园学习 实验 生物 流式细胞仪 动物实验 基因 细胞实验 免疫荧光 免疫组化 HE染色sci...
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生物信息学入门使用RNAseqcounts数据进行差异表达分析(DEG) 原文网址:https://blog.csdn.net/tuanzide5233/article/details/88785486 差异表达分析通常作为根据基因表达矩阵进行生物信息学分析的第一步,有助于我们观察基因在不同样本中的表达差异,从而确定要研究的基因和表型之间的联系。常用的基因表达数据来自基因芯片或...
本发明属于生物信息学领域,具体涉及一种基于nanopore宏基因组rna-seq的生物信息学检测病原体的方法。 背景技术: 多种病原体(如细菌、真菌、病毒、非典型病原体、寄生虫)可引起人器官感染。临床微生物实验室鉴定病原体的主要方法是培养,但病毒、非典型病原体和寄生虫无法常规鉴定。pcr虽然可以鉴定多种病原体,但仍...
ERR365991_1.fastq.gz * 生物信息学进展 (5) RNA-Seq数据分析 提示 我在服务器上建立了两个目录:tools和genome 现将FastQC、Trimmomatic、bwa、bowtie、bedtools和samtools放在tools目录中,将拟南芥、果蝇、人类基因组序列放在genome目录中 大家可以共同使用。现在,大家已经练习过数据的下载、程序的下载、编译、索引...
cellranger 是10X Genomics的工具，专门用于scRNA-seq数据的预处理和分析。我们将提供cellranger的使用指南，包括如何导入数据、进行聚类分析以及生成表达矩阵等关键步骤。通过以上步骤的详细说明，希望读者能够轻松掌握scRNA-seq和RNA-seq数据处理的基本流程，为后续的生物信息学研究奠定坚实的基础。