除RIP和RNA pull Down以外,凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay, EMSA),也称为凝胶阻滞实验或DNA结合实验,是一种广泛应用于分子生物学的研究技术,也可以用于研究蛋白质(尤其是转录因子)与DNA或RNA之间的相互作用。基本原理 EMSA的基本原理是利用凝胶电泳技术来观察蛋白质与DNA或RNA形成...
Pull Down Assay 一、GST Pull Down Pull down技术的基本原理是将一种蛋白质固定于某种基质上(如Sepharose),但细胞抽提液经过该基质时,可与该固定蛋白相互作用的配体蛋白被吸附,而没有被吸附的“杂质”则随洗脱液流出。被吸附的蛋白可以通过改变洗脱液或洗脱条件而回收下来。通过pull down技术可以确定已知的蛋白与钓...
RNA pull-down assay using nuclear extract 1. Biotin-labeled RNAs were in vitro transcribed with the Biotin RNA Labeling Mix (Roche) and T7 RNA polymerase (Promega), treated with RNase-free DNase I (Promega) and purified with RNeasy Mini Kit (QIAGEN).2. Biotin-HRP Northern blot was ...
RNApull-downassayusingnuclearextract 1.Biotin-labeledRNAswereinvitrotranscribedwiththeBiotinRNALabelingMix (Roche)andT7RNApolymerase(Promega),treatedwithRNase-freeDNaseI (Promega)andpurifiedwithRNeasyMiniKit(QIAGEN). 2.Biotin-HRPNorthernblotwasfollowedbymanufacture’smanual(NorthernMaxkit, Ambion)todemonstrate...
RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。使用体外转录法标记生物素RNA 探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育 液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。质谱...
RNA pull-down assay using nuclear extract 1. Biotin-labeled RNAs were in vitro transcribed with the Biotin RNA Labeling Mix (Roche) and T7 RNA polymerase (Promega), treated with RNase-free DNase I (Promega) and purified with RNeasy Mini Kit (QIAGEN).2. Biotin-HRP Northern blot was ...
1)、RNA Pull-down———In Vitro体外通过RNA探针捕获目的蛋白或其他候选蛋白,获取蛋白后进行WB检测或MS质谱鉴定。也是经典方法。 2)、RNA-EMSA———RNA电泳凝胶迁移阻滞实验(Electrophoretic Mobility Shift Assay),In Vitro体外通过RNA探针检测目的蛋白,反向验证了RIP。是经典方法。
RNA pull-down assay services identify RNA-binding proteins, providing insights into RNA-protein interactions and regulatory mechanisms.
1、RNA Pull-down和RIP、RNA-EMSA、CLIP,这四种研究RNA-蛋白互作技术的内在区别是什么?1)、RNA Pull-down———In Vitro体外通过RNA探针捕获目的蛋白或其他候选蛋白,获取蛋白后进行WB检测或MS质谱鉴定。也是经典方法。 2)、RNA-EMSA———RNA电泳凝胶迁移阻滞实验(Electrophoretic Mobility Shift Assay),In Vitro体外...
究竟会有什么效应,从而更加详细的揭示出DNA与蛋白质...六、拉下实验(Pull-down assay) 拉下实验又叫做...例如RIP(其实就是用ChIP的方法研究细胞内蛋白与RNA...