lncRNA通过与蛋白形成RNA-protein 复合物发挥多样性的功能,例如染色体调控复合物、转录因子及RNP复合物。因此,研究lncRNA-蛋白相互作用的技术可以帮助我们解开lncRNA的生物学功能。常用的用于研究lncRNA-蛋白相互作用的技术,请参见表一。 表一:lncRNA与蛋白之间相互作用的研究方法 (一)RNA-pulldown RNA-pulldown ...
RIP(RNA Immunoprecipitation)和RNA pull-down等实验技术是我们深入研究RNA和蛋白质相互作用的关键工具。RIP运用目标蛋白的特异性抗体分离纯化与蛋白相互作用的RNA，RNA pull-down通过RNA探针捕获与之相互作用蛋白质。上文我们详细了解了RIP技术，今天带大家了解一下RNA pull-down技术。RNA pull-down RNA pull-down是研究...
RIP用于选择性地富集与特定RNA相互作用的蛋白质,RNA pull-down通过RNA探针捕获相互作用蛋白质,而MeRIP则用于甲基化RNA的研究。下面就让我们详细了解一下—— RIP RIP,全称为RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白免疫沉淀,其主要目的是富集RNA分子和与之相互作用的蛋白质,以便进一步分析这些相互作用...
答案是肯定的，即RNA免疫共沉淀（RNA Binding Protein Immunoprecipitation，RIP）技术。 在原理上，RIP与ChIP非常相似，可以理解为只是研究对象不同，RIP主要是研究蛋白-RNA间的互作情况。这些RNA可以是mRNA、非编码RNA甚至病毒RNA等。在实验方案和步骤上，RIP也有自身特别需要注意的地方，后面将会一一介绍。RIP实验可...
1、RIP和RNA-EMSA、CLIP、RNA Pull-down,这四种研究RNA-蛋白互作技术的内在区别是什么? RIP———RNA蛋白免疫沉淀技术是一种用于在细胞天然背景下In Vivo体内探测蛋白质-RNA 相互作用的技术。这种方法可以用于检测特定RBP蛋白与RNA的结合水平。 RNA-EMSA———RNA电泳凝胶迁移阻滞实验(Electrophoretic Mobility Shift ...
RIP实验结果可与其他转录组学、蛋白质组学或表观遗传学数据相结合,综合分析RNA与蛋白的相互作用及其在基因表达调控中的作用机制。例如,结合RNA pulldown实验与RIP实验相互佐证;结合ChIP-Seq和ChIRP-Seq数据可以揭示RNA与DNA结合蛋白的共定位情况;结合RNA-Seq数据可以分析RNA结合蛋白对基因表达的影响等。
2.如期生物“生物技能培训班”正式接受报名,所有课程都是一对一进行;重点是:培训不是理论授课,而是通过实验操作的实践模式完成。课程囊括:qPCR、WB、ELISA、COIP、CHIP、RIP、RNA pull down 、DNA pull down等项目,有需要的老师可以私聊报名哈。 公司项目表: ...
RNA pull down属于前者,通过体外转录的方式将感兴趣的RNA带上标签,通过该标签使RNA结合到树脂支持物上,再加入样本蛋白质与RNA结合,洗涤、洗脱得到与目标RNA结合的蛋白质。 原理: Pull down技术可以确定已知的蛋白与钓出蛋白或已纯化的相关蛋白间的相互作用...
各种RNA与蛋白质相互作用方法之间最明显的区别是互作的RNA和蛋白质是否进行交联以及如何交联:有些方法避免交联(直接IP),另一些方法则使用甲醛进行交联,而另一些方法则使用紫外线(UV)进行交联。.最简单的方法是RIP-seq( RNAimmunoprecipitation and sequencing ),通常但并非总是使用细胞内未加改造的蛋白的抗体富集,并且...