m5C识别蛋白YBX1与甲基化FOXC2 mRNA结合增强其稳定性,从而促进胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭。FOXC2作为一种致癌基因,在多种癌症中过表达,促进细胞增殖并诱导上皮-间充质转化(EMT)。此外,NSUN2通过在p57Kip2 mRNA的3-UTR引入m5C修饰,影响了p57Kip2转录稳定,从而抑制其表达并促进胃癌细胞增殖。p57kip2是CIP/Kip家族...
以果蝇作为模型,揭示了缺乏母源mRNA m5C的胚胎经历了细胞周期延迟,并未能及时启动母源-合子转换(maternal-to-zygotic transition),表明了母源mRNA m5C的功能重要性。从无脊椎动物到人类的谱系,观察到两波m5C调控创新:更高等动物在mRNA的5'端获得由NSUN2介导的顺式m5C位点,同时伴随着更具结构化的5'UTR区域的出现;...
常规mRNA m5C甲基化测序(RNA-BS): mRNA分离后首先通过亚硫酸盐处理,非甲基化的C转变为U,m5C修饰的碱基保持不变,结合高通量测序,可以对RNA上的每一个C碱基修饰进行定位与定量。 常规mRNA +lncRNAm5C甲基化测序(全转录组RNA-BS): 科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序服务,去除人rRNA后,剩余RNA经重亚硫酸盐处理...
与m6A修饰类似,m5C也涉及结合蛋白来改变修饰RNA命运。首个被鉴定m5C修饰的mRNA reader是RNA和出核因子结合蛋白2(ALYREF),这是一个著名的蛋白复合体,有助于mRNA出核(图1和表1)。Y盒结合蛋白1(YBX1)是一种位于细胞质的reader,通过招募ELAV样RNA结合蛋白1(ELAVL1)(mRNA稳定性维持蛋白),以增强m5C修饰mRNA的稳定...
mRNA分离后首先通过亚硫酸盐处理,非甲基化的C转变为U,m5C修饰的碱基保持不变,结合高通量测序,可以对RNA上的每一个C碱基修饰进行定位与定量。常规mRNA +lncRNAm5C甲基化测序(全转录组RNA-BS): 易基因科技建立的升级版m5C RNA甲基化测序服务,去除人rRNA后,剩余RNA经重亚硫酸盐处理后,结合高通量NGS策略,可在全转...
2022年4月1日,《Biomark Res》杂志发表了题为“Biological roles of RNA m5C modification and its implications in Cancer immunotherapy”的综述文章,综述了RNA m5C甲基化修饰的生物学作用及其在癌症免疫治疗中的潜在机制。 期刊:Biomarker Research 摘要
5-methylcytosine (m5C): 自从1958年在RNA中被发现以来,DNA中5位胞嘧啶残基的甲基化m5C被发现广泛分布于RNA中,包括tRNA、rRNA、mRNA、增强子RNA (enhancer RNA, eRNA)和miRNA。研究发现m5C修饰在不同真核生物的受精卵中广泛发生在母体mRNA上,调节小鼠、斑马鱼和果蝇的胚胎发生。m5C修饰在RNA的稳定,输出和翻译中起着...
技术简介m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲...
该研究结果揭示了一种新的基因表达调控机制,即植物中组蛋白修饰和 RNA m5C甲基化之间的相互作用。作者发现植物特异性PcG蛋白EMF1具有双重作用,可作为激活剂或阻抑剂...
m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C广泛存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。目前对m5C RNA的检测手段主要是用重亚硫酸盐(Bisulfite)处理样品,处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩...