转录组是指一个细胞、组织或生物体在特定条件或状态下转录的所有RNA集合。RNA-Seq利用新一代测序技术，通过测序细胞或组织中的所有RNA，分析其种类和丰度，从而获得基因表达的全景图。转录组测序的主要步骤包括：RNA提取、构建文库、测序和数据分析。二、转录组测序的主要步骤 RNA提取：从样本（如细胞、组织、血液等）...
转录组,也叫做 RNAseq,是指特定类型细胞中全体转录本的集合。在转录组中,既包括编码蛋白的信使 RNA(mRNA),也包括不编码蛋白的 rRNA,tRNA,小RNA,lncRNA 等非编码 RNA。这些 RNA 转录本彼此协同作用,共同来调控细胞的生长,发育,凋亡等一系列重要的生理过程。对于转录本的研究通常包括定性和定量两个方面。 转录组...
RNA-seq是一种集合实验方法和计算机手段的一种技术,它可以确定生物样本中RNA序列的特征性和丰度,也就是说,存在于每条单链RNA分子中的腺嘌呤、胞嘧啶、鸟嘌呤和尿嘧啶核糖核酸残基的组成顺序,可以通过RNA测序被识别出来。RNA-seq中的实验方法涉及从细胞、组织或整个动物样本中分离RNA、不同RNA文库的构建、对文库进行...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。RNA-seq帮助大家对RNA生物学的理解会越来越全面:从转录本在何时何地转录到RNA折叠以及分子互作发挥功能等。 1.RNA-seq相关名词 详细介绍了RNA seq的专业词、高通量...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
RNA-seq:用于RNA层面的研究,包括RNA结构组学等,常用于检测所有mRNA的表达量差异。基本步骤包括:提取RNA,富集mRNA合成cDNA并构建文库测序,比对reads,计算reads数定量(测序reads深度10-30Million reads)。1…
RNA-seq即转录组测序技术(Transcriptome sequencing),广义的定义为:对细胞内所有RNA(包括rRNA/ tRNA/ mRNA等)进行高通量测序,狭义的定义为:对细胞内mRNA进行高通量测序,临床检验实验室指的一般为狭义的转录组测序。 融合基因 融合基因(Fusion genes , FG)是...
RNA-Seq是一种全面分析RNA表达的深度测序技术,可以定量地检测和鉴定各种类型的RNA分子.通过对cDNA片段的高通量测序,RNA-Seq可以揭示基因表达水平、发现新的转录本和剪接变体,及其在不同条件下的变化.
RNA测序(RNA-seq)是一种用于研究转录组的工具,转录组是存在于一个或一组细胞中的总RNA分子,包括蛋白质编码RNA(mRNA)和调节或非编码RNA(miRNA、tRNA等)。 2.RNA-Seq有什么用? 1)检测并定量样品的转录组水平 2)检测RNA alternative splicing 3)检测transcript isoform ...