RNA-seq,即RNA测序技术,是一种基于高通量测序技术来分析转录组的方法。它能够对生物样品中的RNA分子进行定量和定性分析,主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、微RNA(miRNA)和非编码RNA(ncRNA)等,通过测序分析反映出它们的表达水平。 RNA-seq技术的主要流程 样品采集:获取生物样品。 RNA提取:从样品中提取RNA。 建库:构建...
RNA-Seq技术,全称RNA测序技术,是一种高通量测序技术,用于分析细胞内转录本(即RNA)的组成和表达情况。这项技术通过测序RNA分子来研究基因表达、转录本的多样性、剪接变异、突变以及其他转录后调控机制。 RNA-Seq技术的工作原理是,首先从生物样本中提取总mRNA,并进行建库和测序。接着,对获得的下机数据进行质量控制,使...
RNA - seq技术呀,可有意思啦! RNA - seq就是对转录组进行测序分析的技术。那什么是转录组呢?简单说就是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和。这就像是一个细胞在某个时刻的“语言集”,RNA - seq就是要解读这个“语言集”的工具。 从原理上讲,RNA -seq的第一步就是提取RNA。这个过程就像...
RNA-seq(转录组学)的分析流程和原理 在开始详细讲解RNA测序之前，我们先来了解一下它的基本步骤：1.建库：提取RNA，富集mRNA或消除rRNA，合成cDNA和构建测序文库。2.测序：然后在高通量平台（通常是Illumina）上进行测序（每个样本测序reads在DNA测序中，读数是对应于单个DNA片段的全部或部分的碱基对（或碱基对概率）...
PCR对RNA-seq的影响?PCR free是什么意思? 在文库制备过程中,我们通过标准的PCR来扩增随机的基因组片段。对于这些模板而言,有的二级结构复杂,有的则热稳定性不好,这些因素都会影响PCR扩增效率。因此,并非所有基因组序列都能在PCR扩增文库中同等体现。 在高通量测序中,之所以引入PCR方法,是为了对微量DNA样本进行扩增,...
《RNA-seq 数据分析实用方法》是科学出版社出版的图书，作者是[芬]E.科佩莱恩，[芬]J.图梅拉，[芬]P.萨默沃，[瑞典]M.赫斯，[芬]G.旺 内容简介 本书全面介绍了RNA-seq数据分析的基本原理和方法，内容涵盖数据分析的整个工作流程，包括质量控制、作图、组装、统计检验和代谢途径分析等。书中在进行理论讲解的...
英文: RNA-Seq and its applications:a new technology for transcriptomics 中文: 转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用更详细... 英文: A Review on The Processing and Analysis of Next-generation RNA-seq Data 中文: 新一代高通量RNA测序数据的处理与分析更详细... ...
在我们的RNA-seq研究中计算覆盖率统计是一个很好的做法。粗略计算,人类基因组有3000Mnt,其中大约1/30被用于蛋白质编码基因。这意味着要测序的RNA大约在100M nt。如果我们使用单端测序100nt(或双端测序50nt),则1M reads给出100M nt序列数据,其等于1×覆盖。普通平台的典型Read输出是30Mreads,将提供30×覆盖。因...