RNA免疫共沉淀—RIP-seq(RNA Immunoprecipititation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物(RBP)沉淀下来,分离纯化捕获的RNA,结合高通量测序技术对目标RNA进行测序分析。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,蛋白结合对象为RNA,RIP-seq即对富集得到的...
今天,我们就一起走进生物科学的前沿,深度剖析一项至关重要的实验技术——RNA免疫沉淀(RIP)实验的数据分析过程。RIP实验介绍由普拉特泽生物分子检测平台总结分享,分子检测平台为广大科研实验人员提供RIP外包实验服务,通过这一技术的透镜,我们将揭开基因表达调控的神秘面纱,探索生命科学的无限可能。 一、实验设计与流程 ▲细...
Ⅴ再次清洗:孵育后,将enpendoff管置于磁力架上,弃上清,加入500 μl RIP Wash Buffer,涡旋震荡后弃上清,重复一次,然后置于冰上。 三、RNA结合蛋白免疫沉淀 →准备缓冲液:制备RIP Immunoprecipitation Buffer。 →混合裂解液与磁珠:将上一步的enpendoff管放磁力架上,去上清,每管加入900 μl RIP Immunoprecipitation ...
将重悬的细胞在2500g的离心力下离心15分钟,以沉淀细胞核。随后,将细胞核沉淀重悬于新鲜的RIP缓冲液中。请注意,在整个过程中应使用不含RNA酶的试剂和工具,以确保RNA的完整性。0染色质剪切 将重悬后的细胞核分成两份,每份500μL,一份用于对照实验,另一份用于免疫沉淀。接着,使用匀浆器对染色质进行机械剪切...
RIP-seq是将RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP)与二代测序技术(NGS)相结合以研究细胞内RNA与蛋白互作的技术,RIP利用目标蛋白抗体把相应的RNA-蛋白复合物(RNA Binding Protein,RBP)沉淀下来,然后经过富集和纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。
答案是肯定的,即RNA免疫共沉淀(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RIP)技术。 在原理上,RIP与ChIP非常相似,可以理解为只是研究对象不同,RIP主要是研究蛋白-RNA间的互作情况。这些RNA可以是mRNA、非编码RNA甚至病毒RNA等。在实验方案和步骤上,RIP也有自身特别需要注意的地方,后面将会一一介绍。RIP实验可...
RIP实验基本原理 1、用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的 RNA 结合蛋白。 2、防止非特异性的 RNA 的结合。 3、免疫沉淀把 RNA 结合蛋白及其结合的 RNA 一起分离出来。 4、结合的 RNA 序列通过 microarray(RIP-Chip),定量 RT-PCR 或高通量测序(RIP-Seq) 方法来鉴定。
其中,RIP技术(RNA结合蛋白免疫沉淀)尤为关键,它通过针对目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过纯化分离后,可以对复合物上的RNA进行qPCR验证或测序分析。RIP技术作为一种研究细胞内RNA与蛋白结合情况的方法,已成为揭示转录后调控网络动态过程的重要手段。在分子相互作用的技术领域中,除了RIP技术,还有...
RIP-seq是将RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP)与二代测序技术(NGS)相结合以研究细胞内RNA与蛋白互作的技术,RIP利用目标蛋白抗体把相应的RNA-蛋白复合物(RNA Binding Protein,RBP)沉淀下来,然后经过富集和纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。
RNA immunoprecipitation,RIP RNA免疫沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)是一种基于抗体的技术,可用于定位体内RNA-蛋白质相互作用。技术服务 蛋白实验服务 免疫荧光(IF) Western blot 亚细胞定位 免疫共沉淀(Co-IP) 染色质免疫沉淀法(ChIP) RNA免疫沉淀(RIP) GST Pull-down DNA Pull-down RNA Pull-...