RIP 基于使用针对感兴趣蛋白质的特异性抗体来拉下 RNA 结合蛋白 (RBP) 并靶向 RNA 复合物。 与该蛋白质复合物相关的任何 RNA 也将被分离和纯化，与该复合物结合的 RNA 可以通过 qPCR 或测序分析进行验证。 该技术有多种变体，可分为两大类：天然和交联 RNA 免疫沉淀（活细胞通过甲醛紫外线处理以固定 RNA/...
通过免疫沉淀后得到‘RNA-目的蛋白-目的蛋白抗体-protein A/G-磁珠’复合物,也就是分离出细胞中目的蛋白与RNA的复合物,再进一步将沉淀复合物进行分离纯化,即可得到其中结合的RNA,最后结合qPCR或高通量测序(RIP-seq)等方法来鉴定RNA。
RIP-seq是将RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP)与二代测序技术(NGS)相结合以研究细胞内RNA与蛋白互作的技术,RIP利用目标蛋白抗体把相应的RNA-蛋白复合物(RNA Binding Protein,RBP)沉淀下来,然后经过富集和纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。 RIP-seq对富集得到的RNA片段通过高通量测序,在全转录组...
RNA-蛋白免疫共沉淀试剂盒 RIP Kit RNA Immunoprecipitation Kit RNA-Binding Protein Immunoprecipitation Kit产品优势 信噪比高:优化的实验,信噪比高 流程严谨:包含对照IgG抗体,方便实验质控 简洁高效:包含RIP实验所有**试剂,流程简洁高效实验流程 图1:GenSeq(R) RIP试剂盒实验流程应用场景1.Ago蛋白结合RNA的检测2.m6A...
RNA IP-seq是研究细胞内 RNA 与蛋白结合情况的技术,以 RNA 免疫共沉淀(RIP)实验为基础,采用针对目标蛋白的特异性抗体把相应的 RNA 与蛋白质复合物沉淀出来,分离纯化复合物中的 RNA,通过 Illumina 测序,在全转录组范围内研究被目标蛋白特异性结合的 RNA 区域或种类,并比较样品/组间差异。
RNA结合蛋白(RNA binding protiens)结合RNA调控基因表达,与RNA相互作用是联系多组学的桥梁,从表观遗传到蛋白代谢,RNA蛋白互作的研究是高分文章必不可少的.
免疫共沉淀(CHIRP)实验原理 CHIRP(Chromatin Isolation byRNA Purification)是通过结合生物素的核酸探针,将目标RNA拉下来,与之共同作用的DNA染色体片 段(DNA与蛋白质复合体)就会被吸附下来,后可以通过aRT-PCR.WB.测序分析和质谱分析等检测RNA.DNA和蛋白质。
专题(一)介绍转录因子与靶基因启动子、专题(二)介绍蛋白质与蛋白质的互作预测。本次介绍蛋白质与RNA互作。先上应用实操总结(同专题一/二总结类似,看过可忽略直接进入实操正文):优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结合...
本Protein A+G Sepharose主要用于免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)、免疫共沉淀(Co-IP)或者抗体的纯化。 Protein A+G Sepharose适合于免疫沉淀所有Protein A Sepharose和Protein G Sepharose 单独可以免疫沉淀的抗体,包括:mouse IgG1,IgG2a, IgG2b, IgG3, IgA,;rat IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG2c; rabbit、goat、...
1、染色质免疫共沉淀技术的原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小 片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。 2、免疫共沉淀是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于...