利用MeRIP-seq/m6A-seq技术鉴定全基因组范围内具有m6A修饰的区域。其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信息学分析,即可在全基因组范围内对m6A修饰的状况进行系统研究。MeRIP-seq/m6A- seq是目前研究m6A修饰使用最广泛的技术之一。
研究人员首先证明METTL14(一种m6A甲基转移酶)沉默可抑制成肌细胞的分化,促进C2C12 成肌细胞增殖。采用m6A-seq(MeRIP-seq)测序方法,对猪骨骼肌发育六个胚胎期的纵向转录组和表观转录组图谱进行分析。 结论 MeRIP-seq结果显示:胚胎期骨骼肌发育六个不同阶段的m6A修饰呈现高度的动态变化,且大多数受影响的基因在与骨骼...
MeRIP-Seq (methylated RNA immunoprecipitation sequencing)结合RNA-蛋白免疫共沉淀和高通量测序技术,可实现全转录组水平上RNA甲基化分析。由于甲基化修饰约占所有RNA修饰的60% 以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A),作为最常见的一种转录后修饰,介导了超过80%的RNA甲基化。基于MeRIP-Seq分析RNA甲基化模式,加...
多组学关联分析四象限图(RNA-seq与meRIP-seq) 送样要求 样本物种: 仅限人、大小鼠物种,其他物种需评估 500ng--20ug 总RNA 5x10⁶~10⁷ 细胞数量 10~20mg 组织质量 基础与高级分析 基本分析 1.测序原始reads去接头,质量控制(QC) 2.参考基因组比对(Mapping) 3.富集区域鉴定(PeakCalling) 4.富集区域注释...
1 MeRIP 测序 m6A 甲基化修饰在基因表达调控、mRNA 剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA 寿命和降解、介导环状RNA 翻译等方面扮演重要角色。甲基化RNA 免疫共沉淀结合高通量测序（Methylated RNA Immunoprecipitation with Next Generation Sequencing ，MeRIP-Seq ）是研究细胞内转录组表观修饰的最新技术。这项技术通过...
1. 为什么MeRIP-seq需要测两个样本(Input和IP)? 常规m6A MeRIP-seq中Input和IP构成一对组合。IP样品使用m6A抗体特异性富集具有甲基化修饰的RNA,而Input则是仅含有RNA的对照,通过消除背景噪音和峰值PEAK计算,将两个样本不同m6A区域计算出来。 2. MeRIP-seq后续的实验怎么安排?
图1:m6A甲基化和去甲基化示意图 目前对m6A的转录组研究方法为MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)的方法,其原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。 服务...
甲基化RNA免疫共沉淀结合高通量测序(MethylatedRNAImmunoprecipitationwithNextGenerationSequencing,MeRIP-Seq)是研究细胞内转录组表观修饰的最新技术。这项技术通过使用N6-甲基腺嘌呤抗体富集高甲基化的RNA片段,然后结合高通量测序,在全转录组范围内研究发生甲基化的RNA区域,从而比较不同细胞、组织、样本间的RNA甲基化修饰...
一、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)测序技术原理 表观转录组研究中，m6A RNA甲基化修饰是重要现象之一。m6A主要发生在终止密码子和3’UTR附近，参与调控mRNA的稳定性、二级结构、microRNA靶标识别以及基因表达调控等。MeRIP-seq/m6A-seq技术通过特异识别m6A修饰的抗体，对细胞内具有m6A修饰的RNA...
服务简介:RNA N6-甲基腺苷(N6-Methyladenosine, m6A)修饰是真核生物体中最为普遍的一种RNA转录后修饰方式,并涉及多种生理功能与病理过程。MeRIP-Seq是通过能够识别RNA m6A修饰的特异性抗体结合具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,然后对富集下来的RNA片段进行高通量测序的技术,实现在全转录组范围内对m6A修饰进行系统...