MeRIP-seq将RNA上发生m6A修饰的区域富集后进行测序,因此发生m6A修饰的区域,IP文库所覆盖的reads数会显著高于input文库,从而形成“峰(peak)”。检测这些峰的位置即可得到RNA上发生m6A修饰的位置。 鉴定得到m6A修饰后,再对m6A修饰进行注释、分布统计、motif鉴定等分析。 (四) 差异m6A修饰区域的鉴定 差异m6A修饰(即差异p...
m6A是RNA上最丰富的一种修饰,平均每条转录本有1~3个m6A修饰。易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、...
多组学关联分析四象限图(RNA-seq与meRIP-seq) 送样要求 样本物种: 仅限人、大小鼠物种,其他物种需评估 500ng--20ug 总RNA 5x10⁶~10⁷ 细胞数量 10~20mg 组织质量 基础与高级分析 基本分析 1.测序原始reads去接头,质量控制(QC) 2.参考基因组比对(Mapping) 3.富集区域鉴定(PeakCalling) 4.富集区域注释...
易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症发生与发展、药物应答等研究领域;可应用...
锐博生物>产品与服务索引>高通量测序>RNA甲基化测序(MeRIP) MeRIP-Seq (methylated RNA immunoprecipitation sequencing)结合RNA-蛋白免疫共沉淀和高通量测序技术,可实现全转录组水平上RNA甲基化分析。由于甲基化修饰约占所有RNA修饰的60% 以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A),作为最常见的一种转录后修饰,介导...
m1A RNA修饰的检测,易基因采用基于抗体富集的甲基化RNA免疫沉淀测序方法(MeRIP-seq/m1A-seq),该技术利用m1A特异性抗体富集发生m1A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,对RNA上的m1A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。
N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰是真核生物mRNA中普遍的内部修饰,通常m6A修饰嵌入在5’-DRACH-3’(D=G/A/U,R=G/A,H=A/U/C)保守的共有序列中,而且主要富集在终止密码子区域,表明m6A修饰的分布特征可能具有重要的生物学功能。m6A RNA甲基化测序(MeRIP-seq)是以RNA免疫共沉淀为基础,采用特异抗体对发生m6A甲基化修饰...
图1:m6A甲基化和去甲基化示意图 目前对m6A的转录组研究方法为MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)的方法,其原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。 服务...
1. 为什么MeRIP-seq需要测两个样本(Input和IP)? 常规m6A MeRIP-seq中Input和IP构成一对组合。IP样品使用m6A抗体特异性富集具有甲基化修饰的RNA,而Input则是仅含有RNA的对照,通过消除背景噪音和峰值PEAK计算,将两个样本不同m6A区域计算出来。 2. MeRIP-seq后续的实验怎么安排?
在RNA甲基化研究方法中，MeRIP-seq作为检测m6A修饰的方法，因其可以在全基因组范围内进行m6A修饰检测，也...