RNA免疫共沉淀—RIP-seq(RNA Immunoprecipititation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物(RBP)沉淀下来,分离纯化捕获的RNA,结合高通量测序技术对目标RNA进行…
RNA免疫共沉淀—RIP-seq(RNA Immunoprecipititation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物(RBP)沉淀下来,分离纯化捕获的RNA,结合高通量测序技术对目标RNA进行测序分析。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,蛋白结合对象为RNA,RIP-seq即对富集得到的...
RIP-Seq:用于构建目的蛋白的RNA互作组数据,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异。 RIP-Seq是一种检测细胞内蛋白/RNA互作组的高通量技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和RNA测序技术对目的蛋白在特定细胞/组织内的互作蛋白/RNA,进行系统的检测和分析。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白/RNA互作组...
RNA纯化实验方法: 1.制备蛋白酶K缓冲液。每个免疫沉淀需要150 µL蛋白酶K缓冲液,包含117 µL RIP洗涤缓冲液,15 µL 10% SDS,18 µL 10 mg/mL蛋白酶K。 2.在150µL的蛋白酶K缓冲液中重新悬浮第三节第8步中的每个免疫沉淀。 3.将第三节第4步的input样品解冻,在试管中加入107 µL RIP洗涤...
RIP-seq服务优势*辉骏生物 1 十年服务经验,客户成果发表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上,售后技术支持将一直保持到客户发表文章。 2 对围绕RNA结合蛋白开展的整体课题提供全方位指导,包括上下游实验设计和结合蛋白的多方法验证等。 3
1、 实验简介 RIP(RNA结合蛋白免疫沉淀)是研究体内 RNA 与蛋白结合情况的技术,主要包括RIP-qPCR和RIP-seq两种;其中RIP-qPCR用来验证与目标蛋白结合的已知RNA,RIP-seq用来筛选与目标蛋白结合的未知RNA。 2、 实验流程 3、 样品要求 1) 动物组织样品:>100mg (黄豆粒大小) ...
详细解读:RIP-seq项目文章|nature子刊揭示低氧诱导AGO2线性泛素化调控肿瘤发生发展机制 miRNA 对 mRNA 的表达沉默作用需要 AGO2 蛋白的介导。在常氧和缺氧两种环境下,作者针对 AGO2 蛋白进行了 RIP-seq 实验,揭示了缺氧处理对 AGO2 结合的 mRNA 的影响。累积分数分析显示,缺氧显着降低了 mRNA 与 AGO2 的相互作...
RNA结合蛋白研究领域的RIP-seq实验，是一种通过抗体捕获细胞内RNA与蛋白复合物的高通量测序技术。它在理解转录后调控网络动态中扮演着关键角色，主要应用于研究RNA与蛋白的相互作用，包括非编码RNA如LncRNA、miRNA等。以下是RIP-seq实验的基本分析流程和两个案例分享。实验流程包括前期准备，如提供基因组信息...
RIP-Seq是一种研究细胞内蛋白与RNA相互作用的高通量技术。它结合了免疫共沉淀与RNA测序，用于系统性检测和分析特定细胞或组织中目的蛋白的RNA互作组。该技术不仅适用于目的蛋白的RNA互作组数据检测，还适用于不同遗传背景或实验条件下的互作组差异研究。因此，RIP-Seq是探究细胞内蛋白与RNA调控网络的重要...
RIP-seq实验中的阳性对照和阴性对照是什么?1. 阳性对照:一般用anti-RNA polymerase II抗体,因为RNA polymerase II是通用转录因子,在所有细胞中都能结合基因的核心启动子区,因此理论上,ChIP后PCR会有条带。一般阳性对照不进行测序。2. 阴性对照:分为mock和input两种,二者均能起到减少假阳性的作用。mock:用普通IgG...