CHIP实验是一种用于检测蛋白质与DNA特定区域相互作用的技术。它可以帮助研究人员了解转录因子、组蛋白修饰...
一、免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP) 免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)主要原理是根据抗原和抗体的特异性结合,利用抗体将靶标蛋白(即抗原)分离出来,只是为了检测某一种蛋白的表达情况。co-IP、ChIP、RIP等技术由IP演化而来,可以用来研究与蛋白结合的分子。 二、免疫共沉淀技术(co-Immunoprecipitation, co-IP...
RIP的实验原理和CHIP类似,是利用某一蛋白的抗体,将目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化就可以捕获和目标蛋白互作的RNA分子,再对捕获的RNA进行定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)方法来进行鉴定。RIP实验当前已经衍生出很多方法,可以主要分为两大类,自然沉淀法(Native methods)和交联RNA...
RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,但由于研究对象是RNA-蛋白复合物而不是DNA-蛋白复合物,RIP实验的优化条件与ChIP实验不太相同(如复合物不需要固定,RIP反应体系中的试剂和抗体绝对不能含有RNA酶,抗体需经RIP实验验证等等)。RIP技术下游结合microarray技术(微阵列)被称为RIP-Chip,帮助我们更高...
文末还有《实验Protocol大全》,有需要可自行领取! 一、免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP) 免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)主要原理是根据抗原和抗体的特异性结合,利用抗体将靶标蛋白(即抗原)分离出来,只是为了检测某一种蛋白的表达情况。co-IP、ChIP、RIP等技术由IP演化而来,可以用来研究与蛋白结合的分子。
ChIP-qPCR 数据需要针对可变性来源进行标准化,包括染色质数量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。 两种常用的标准化 ChIP-qPCR 数据方法——Percent Input法和富集倍数法(Fold Enrichmen)。与input相关的ChIP-qPCR数据包括ChIP的背景水平和input染色质的标准化。建议ChIP 实验重复,尽可能将结果与背景信号和标准...
RIP实验可以看作是ChIP技术的类似应用,但它的研究对象是RNA-蛋白复合物而非DNA-蛋白复合物。因此,在具体操作上,RIP实验的步骤会与ChIP实验有所不同。RIP实验的流程可以概括为以下几个步骤:首先,收集细胞并制备细胞裂解液;其次,将细胞裂解液与目的RNA结合蛋白和抗体混合,进行免疫沉淀;然后,洗涤并纯化免疫沉淀...
免疫沉淀(ip)实验:CoIP、RIP、CHIP的区别 IP实验原理 IP又称免疫沉淀(Immunoprecipitation),是利用抗原和抗体的特异性结合以及“proteinA/G”特异性结合到抗体的FC片段的现象开发出来的方法,简单来说,抗原与抗体类似于锁和钥匙之间的关系,一把钥匙(抗体)只能开一把锁(抗原),而钥匙可以通过钥匙链(细菌蛋白的“...
ChIRP和RIP实验 证实circRNA能够与FOXA1和TET1蛋白结合。图4. 通过ChIP和双荧光素酶试验验证circRNA影响FOX1/TET1结合LIG1启动子(Ref. Fig.7)。调控复合体功能:ChIP实验证实FOXA1和TET1结合在LIG1启动子的甲基化修饰区域,而circRNA的抑制降低了这种结合能力。MS-PCR实验显示,沉默circRNA或TET1增加了LIG1启动子的...
#免疫沉淀实验# CoIP、CHIP和RIP这些技术之间的差异主要在于与抗体结合的物质。CoIP中的B代表蛋白质,CHIP中的B代表DNA,而RIP中的B则代表RNA。01CoIP技术 CoIP技术利用抗体的特异性反应来纯化和富集目标蛋白质。具体流程如下:先将抗体与细胞裂解液或表达上清中的相应蛋白结合,再与蛋白A/G偶联的琼脂糖或Sepharose...