必应词典为您提供raw-reads的释义,网络释义: 原始数据;原始读数;
表示原始测序数据,与clean reads相对应。clean reads clean reads是在raw reads基础上经过一定条件过滤后的数据。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。转录组测序与基因表达谱的区别 转录组测序...
clean reads是在raw reads基础上经过一定条件过滤后的数据
clean reads是raw reads过滤后的序列片段合集。clean base (bp) 是clean reads的统计量,相应的raw base (bp)是raw reads的统计量。一般clean reads与raw reads只是一个描述性短语,没有统计量的意思,但就该例而言(Table 1),clean reads代表了经过滤处理后的有效片段数目。于是当采用双端150bp测序时,clean base=...
ls~/ChIP_seq/raw/*.fastq.gz | xargs fastqc -t 4 multiqc ~/ChIP_seq/raw/ 最终的结果表明这6个数据的质量都很好,所以原文并没有进行额外的过滤操作。需要注意的是,在该文献中ein2-5_air_MPGB_1和ein2-5_ethylene_MPGB_1两个阴性对照呈现出reads重复率高的特征 ...
又统计了一下fq里面的reads数量 这一步没有什么实质性的作用,但能加深对reads比对率、唯一比对、多比对、reads数、比对记录数等的理解。"Duplicate reads were removed using SAMtools."相关的NC文章是这样做的。并用samtools index为4个待分析的bam建立索引。文章只强调了--nomodel, -p 0.01这两个...
Raw reads from Kocuria sp. str. UCD-OTCP genome sequencing projectCoil, DavidEisen, JonathanDarling, AaronLang, JennaDoctor, Jessica
原始序列片段
raw reads实验做不出来数据分析不出来 k收起 f查看大图 m向左旋转 n向右旋转û收藏 转发 评论 ñ3 评论 o p 同时转发到我的微博 按热度 按时间 正在加载,请稍候...293关注 1090粉丝 85微博 微关系 他的关注(293)
Curtobacterium-flaccumfaciens-raw-readsdoi:10.6084/m9.figshare.644657Coil, DavidAaron DarlingLang, JennaEisen, JonathanFlanagan, Jennifer