clean reads是raw reads过滤后的序列片段合集。clean base (bp) 是clean reads的统计量,相应的raw base (bp)是raw reads的统计量。一般clean reads与raw reads只是一个描述性短语,没有统计量的意思,但就该例而言(Table 1),clean reads代表了经过滤处理后的有效片段数目。于是当采用双端150bp测序时,clean base=...
clean reads是在raw reads基础上经过一定条件过滤后的数据。转录组（transcriptome）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。转录组测序与基因表达谱的区别 转录组测序技术 把mRNA,smallRNA,and NONcoding RNA等用高通量测...
首先将储存于~/miRNA/trimmed_data的各样本clean data.fastq文件转化为不含质量信息的fasta文件,并将序列本身作为序列名字(eg: >AGCT),然后输入collapse_reads_md.pl进行折叠,以样本组别前两个字母(co/tr)+生物学重复编号(1/2/3)作为三字符样本编号。 脚本命名为get.collapsed.reads.sh,储存于~/miRNA/scripts路...
原因如下： 一般来说，测序仪下机的数据称为raw data，经过以下两步处理之后变成了clean data才能用于数据分析：(1) 去除含有接头的Reads；(2) 去除低质量的Reads（包括去除N的比例大于10%的Reads；去除质量值Q≤10的碱基数占整条Read的50%以上的Reads）不过raw data和clean data并没有一个权威的定...
raw reads就是测序完后的原始序列，而cleanreads是去除接头以及一些质量值较低的reads后产生的。
Clean reads were screened from raw reads by removing 青云英语翻译 请在下面的文本框内输入文字,然后点击开始翻译按钮进行翻译,如果您看不到结果,请重新翻译! 翻译结果1翻译结果2翻译结果3翻译结果4翻译结果5 翻译结果1复制译文编辑译文朗读译文返回顶部
4. 干净数据(Clean data。数据还有不干净的?):某些实验室根据其自身的判断标准,在PF data的基础上,进一步删除质量不好的reads后得到的数据。常见的删除动作有:去接头、去N含量高的reads、去质量评分低的reads、去掉每个read的最后几个碱基,等等。 Clean data是国内叫法;PF data是来自Illumina的概念,是广为接受的...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 一般来说,raw data经过以下处理之后叫clean data1,去掉低质量的reads2,去掉包含接头(adaptor)的reads3,去掉包含N过多的reads 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 相似问题 我看了你对“转录组测序与转录表达谱测序的异同”的回答我非常感兴趣, 转录组测序和数字表...
测序数据各项指标显示各样本的测序质量良好:在产生的数据量方面,24个样本的raw reads和clean reads的平均条数分别为62157129和61042644;在错误率和GC含量方面,24个... 伍鑫 - 西南大学 被引量: 0发表: 2021年 泡叶藻岩藻多糖结构解析及其抗炎构效关系研究 采用HPGPC,HPLC-MS,甲基化,FT-IR光谱和NMR光谱等分析方...
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