必应词典为您提供raw-reads的释义,网络释义: 原始数据;原始读数;
表示原始测序数据,与clean reads相对应。clean reads clean reads是在raw reads基础上经过一定条件过滤后的数据。转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。转录组测序与基因表达谱的区别 转录组测序...
clean reads是在raw reads基础上经过一定条件过滤后的数据
clean reads是raw reads过滤后的序列片段合集。clean base (bp) 是clean reads的统计量,相应的raw base (bp)是raw reads的统计量。一般clean reads与raw reads只是一个描述性短语,没有统计量的意思,但就该例而言(Table 1),clean reads代表了经过滤处理后的有效片段数目。于是当采用双端150bp测序时,clean base=...
这一步没有什么实质性的作用,但能加深对reads比对率、唯一比对、多比对、reads数、比对记录数等的理解。 4. 去除PCR重复 "Duplicate reads were removed using SAMtools."相关的NC文章是这样做的。 ls *bam | while read id; do samtools markdup -r $id $(basename $id ".bam").sm.bam & done ...
又统计了一下fq里面的reads数量 这一步没有什么实质性的作用,但能加深对reads比对率、唯一比对、多比对、reads数、比对记录数等的理解。"Duplicate reads were removed using SAMtools."相关的NC文章是这样做的。并用samtools index为4个待分析的bam建立索引。文章只强调了--nomodel, -p 0.01这两个...
原始序列片段
Raw data 或 Raw reads 结果以FASTQ文件格式存储 结果每四行一显示 第一行 @开头,随后为illumina测序识别符合描述文字 第二行 碱基序列 第三行 +开头 第四行 对应序列的测序质量的ASCII码 Base calling,Q值越大精度越高,ASCII数值减33得到Q值 质控——fastqc ...
git-sym show run/ecoli -> in dir 'run/ecoli' <- back to dir '/Users/paradox/Documents/asc/FALCON-integrate/FALCON-examples' symlink: 'run/ecoli/data/ecoli.m140913_050931_42139_c100713652400000001823152404301535_s1_p0.subreads' symlink: 'run/ecoli/logging.ini' / run/ecoli/data/ecoli....
The ReadRawContent method reads at most count bytes into buffer, without decoding them, starting at offset bytes. Namespace: Microsoft.Exchange.Data.Mime Assembly: Microsoft.Exchange.Data.Common (in Microsoft.Exchange.Data.Common.dll) Syntax C# 复制 public int ReadRawContent( byte[] buffer, ...