r-hsa通路

2025-02-05 10:03:30

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如何在R中绘制个性化的KEGG通路图?_Log_int<-_hsa

将差异分析结果映射到目标KEGG通路 #载入DESeq2差异分析结果表: load('DESeq2-TCGA-CHOL.Rdata') dds head(res) #使用ggraph包可视化KEGG通路,并在各节点映射差异分析结果数值(如Log2FC、adjustp等); g<- pathway('hsa04110') %>% mutate(Log2FC = assign_deseq2(res), padj= assign_deseq2(res, c...
如何在R中绘制个性化的KEGG通路图?_Log_int<-_hsa

将差异分析结果映射到目标KEGG通路 #载入DESeq2差异分析结果表: load('DESeq2-TCGA-CHOL.Rdata') dds head(res) #使用ggraph包可视化KEGG通路,并在各节点映射差异分析结果数值(如Log2FC、adjustp等); g<- pathway('hsa04110') %>% mutate(Log2FC = assign_deseq2(res), padj= assign_deseq2(res, c...
如何在R中绘制个性化的KEGG通路图?_Log_int<-_hsa

将差异分析结果映射到目标KEGG通路 #载入DESeq2差异分析结果表: load('DESeq2-TCGA-CHOL.Rdata') dds head(res) #使用ggraph包可视化KEGG通路,并在各节点映射差异分析结果数值(如Log2FC、adjustp等); g<- pathway('hsa04110') %>% mutate(Log2FC = assign_deseq2(res), padj= assign_deseq2(res, c...