将差异分析结果映射到目标KEGG通路 #载入DESeq2差异分析结果表: load('DESeq2-TCGA-CHOL.Rdata') dds head(res) #使用ggraph包可视化KEGG通路,并在各节点映射差异分析结果数值(如Log2FC、adjustp等); g<- pathway('hsa04110') %>% mutate(Log2FC = assign_deseq2(res), padj= assign_deseq2(res, c...
目前诊断HCC最有效的标志物,但仍有约30-40%的患者,这项指标正常,进而导致一些病人漏诊.因此,学者们一直在探索新的HCC诊断标志物和治疗靶点.环状RNA是非编码RNA中的一种,是近些年研究的热点;其在癌症发展中的诊断,治疗及预后价值逐渐被证明.2019年,国内外唯一一篇研究报道中发现,环状RNAHsa_circ_0008583在HCC组织...
将差异分析结果映射到目标KEGG通路 #载入DESeq2差异分析结果表: load('DESeq2-TCGA-CHOL.Rdata') dds head(res) #使用ggraph包可视化KEGG通路,并在各节点映射差异分析结果数值(如Log2FC、adjustp等); g<- pathway('hsa04110') %>% mutate(Log2FC = assign_deseq2(res), padj= assign_deseq2(res, c...
将差异分析结果映射到目标KEGG通路 #载入DESeq2差异分析结果表: load('DESeq2-TCGA-CHOL.Rdata') dds head(res) #使用ggraph包可视化KEGG通路,并在各节点映射差异分析结果数值(如Log2FC、adjustp等); g<- pathway('hsa04110') %>% mutate(Log2FC = assign_deseq2(res), padj= assign_deseq2(res, c...