其中,genes.tsv是基因名称(需要注意的是,我使用的cellranger是2.2版本,目前v3版本的gene.tsv已经改为 features.csv);barcodes.tsv是每一个barcode的序列,也就是每一个细胞的ID;matrix.mtx就是count矩阵。 >library(Matrix)#读取三个文件>barcode.path<-paste0("barcodes.tsv")>features.path<-paste0("genes.t...
一、Cellranger功能 Function of Cellranger Cellranger包主要功能是将公司测序并经过初步处理产生的fastq数据转化成为可读入R语言Seurat包的outs文件夹,主要是filtered_feature_bc_matrix文件夹,里面具体包括barcodes.tsv.gz;features.tsv.gz以及matrix.mtx.gz三个文件。 二、开发者信息 Developer information CellRanger ...
一、Cellranger功能 Function of Cellranger Cellranger包主要功能是将公司测序并经过初步处理产生的fastq数据转化成为可读入R语言Seurat包的outs文件夹,主要是filtered_feature_bc_matrix文件夹,里面具体包括barcodes.tsv.gz;features.tsv.gz以及matrix.mtx.gz三个文件。 二、开发者信息 Developer information CellRanger ...