--- ### `scale_fill_viridis()` 函数使用指南 ### 1. 简介 `scale_fill_viridis()` 是 ggplot2 扩展包(如 viridisLite 或 scales)提供的一个函数,它允许你在创建图表时使用 Viridis 颜色渐变来填充图形的区域。Viridis 颜色渐变是一种在科学可视化中广泛使用的颜色方案,因为它具有良好的色盲友好性和亮度线...
fill_color= 'blue') #若目标基因对应数值向量(如Log2FC等),可使用连续型色板: ints<- c(-2,2,4,6,8) |> setNames(int) ints highlight_entities('hsa04151', ints) + scale_fill_viridis # 02 将差异分析结果映射到目标KEGG通路 #载入DESeq2差异分析结果表: load('DESeq2-TCGA-CHOL.Rdata'...
ylim(-200,2000)+scale_fill_viridis(option="D",discrete=T) 当然了,大家也可以指定颜色,可见推文:R语言绘图—颜色指定。 2.6主题美化 这里主要是改变一下主题的颜色、去除图例等。 ggplot(data = myda,aes(x=reorder(disease,-ynn),y=ynn,fill=disease))+ geom_bar(width = 0.8,stat = "identity")+...
官方定义:viridis—Default Color Maps from 'matplotlib',即matplotlib中默认的色带。使用此包中的色带来制作漂亮的图表,可以更好地展示数据,更容易被具有色盲的人阅读,并支持灰度打印。 在ggplot中,可是使用scale_color_viridis() 、scale_fill_viridis(),来进行调整色带。 library(tidyverse) ggplot(data.frame(x ...
连续填充色设置函数还有scale_fill_gradient,scale_fill_gradient2和 scale_fill_gradientn,其中scale_fill_gradient的用法和作用和scale_fill_continuous完全相同(其实ggplot2早期版本连续颜色标尺默认使用scale_fill_gradient,没有scale_fill_continuous函数;后者可能是H.W头脑清楚以后加进去的,相当于前者的别名)。scale_...
# Matplolib 'viridis' color map # also designed to be perceived by readers with the most common form of color blindness #scale_fill_viridis函数来源于此包, # 其参数 option用于设置颜色 "magma" (or "A"), "inferno" (or "B"), "plasma" (or "C"), ...
4.1 wesanderson和viridis函数生成多个连续颜色 4.2 使用colorRampPalette获取多个连续颜色 在使用R绘图调色的时候,每次都要选择很久,有时候也会忘记相关的记录,特此总结一些自己常用的。 1、R base颜色版 1.1 R base颜色 R语言中颜色设置使用通用的颜色代码就行,RGB格式、16进制格式,或者使用相关的颜色字符。
总之,viridis系列的配色对色盲会比较友好。 viridis能和ggplot完美结合使用: 离散颜色可用scale_color_viridis() ;连续颜色可用scale_fill_viridis()。 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 # link:https://cran.r-project.org/web/packages/viridis/vignettes/intro-to-viridis.html ...
我们现在可以使用 scale_fill_continuous() 方法为图形提供模式。参见示例: DemoGraph + scale_fill_continuous(type = "gradient") 上面的代码为图形提供了渐变模式。见输出: 我们还可以在 scale_fill_continuous 方法中使用 Viridis 选项。 DemoGraph + scale_fill_continuous(type = "viridis") 上面的代码给...
scale_fill_continuous(..., type=getOption("ggplot2.continuous.fill")) 该方法使用options()来确定默认设置。其中ggplot2.continuous.fill是连续色标的默认值。 scale_fill_continuous方法的参数可以是Viridis或gradient。让我们试试这个方法的一个例子。