DRIP-seq和DRIPc-seq通过基于S9.6的DNA-RNA免疫沉淀高通量测序进行高分辨率、链特异性R-loop定位[2] 期刊:NATURE PROTOCOLS 影响因子:IF 13.1细胞 样本:骨骼肌 本研究通过DRIP-seq和DRIPc-seq进行R-loop定位,结果表明该技术可以检测任何感兴趣的基因组中R-loop结构的稳态分布。更重要的是,这些方法可用于由遗传突...
DRIP-seq和DRIPc-seq通过基于S9.6的DNA-RNA免疫沉淀高通量测序进行高分辨率、链特异性R-loop定位[2] 期刊:NATURE PROTOCOLS 影响因子:IF 13.1细胞 样本:骨骼肌 本研究通过DRIP-seq和DRIPc-seq进行R-loop定位,结果表明该技术可以检测任何感兴趣的基因组中R-loop结构的稳态分布。更重要的是,这些方法可用于由遗传突...
DRIPc-Seq(DNA:RNAimmunoprecipitation followed bycDNA conversion coupled to high throughput sequencing)是一种基于抗体富集,RNA反转录链建库的“DNA:RNA杂合链免疫共沉淀及高通量测序技术”,利用针对R-Loop结构中的RNA链反转录进行建库测序,能够在全基因组范围内检测R-Loop结构中的RNA链;针对长链mRNA、LncRNA及circR...
DRIPc-Seq(DNA:RNA immunoprecipitation followed by cDNA conversion coupled to high throughput sequencing)是一种基于抗体富集,RNA反转录链建库的“DNA:RNA杂合链免疫共沉淀及高通量测序技术”,利用针对R-Loop结构中的RNA链反转录进行建库测序,能够在全基因组范围内检测R-Loop结构中的RNA链;针对长链mRNA、LncRNA及c...
目前,主要有两种检测R-loop基因组定位的方法。第一种方法依赖于S9.6抗体,S9.6能够识别DNA:RNA杂合双链,这类方法包括DNA:RNA immunoprecipitation (DRIP),以及基于DRIP的改进的方法:bis-DRIP,S1-DRIP和RDIP【7-10】。这类方法应用比较广泛,但实验操作比较剧烈,会损伤一些相对弱的R-loop,并且研究发现S9.6能够结合双...
图1: R-loop的结构。 R-loop高通量筛选平台 R-loop高通量筛选平台使用S9.6抗体来富集DNA:RNA杂交体后,进行建库和测序分析,检测R-loop结构中RNA链的序列信息,实现精准的R-loop定位,并提供半定量信息。服务 单细胞组学 生物分子凝聚体研究 DNA/RNA/蛋白相互作用 R-loop研究 环状DNA研究 表观转录组学 转录组...
目前,主要有两种检测R-loop基因组定位的方法。第一种方法依赖于S9.6抗体,S9.6能够识别DNA:RNA杂合双链,这类方法包括DNA:RNA immunoprecipitation(DRIP),以及基于DRIP的改进的方法:bis-DRIP,S1-DRIP和RDIP【7-10】。这类方法应用比较广泛,但实验操作比较...
基于此,珠海舒桐科技提供了一种快速、便捷、经济的CBE脱靶效应的检测技术—高通量R-loop脱靶检测,是单碱基编辑中不可或缺的脱靶检测方法,也是广大科研人员进行CBE编辑器筛选的利器。相比于传统的全基因组测序,R-loop高通量脱靶检测省时省力,经济实惠,...
然而,人们也在细菌和真核细胞的整个基因组中检测到了杂交体。每个转录单元发生这种情况的频率尚未确定,但很可能太低,不能代表具有全局功能角色的生理结构,而更像是对细胞产生负面影响的意外结构。 总的来说,R环可能干扰DNA的复制、修复和转录,从而威胁基因组的完整性和功能。因此,细胞已经发展出不同的机制来防止或...
随着能特异性识别R-loop的S9.6抗体出现,R-loop的研究方法也得到了更好的改进。S9.6抗体不依赖于序列而能和R-loop结合,因此利用该抗体可以对R-loop进行免疫荧光检测、提取基因组后进行dotblot检测,还可以用S9.6做免疫沉淀,再进行qPCR分析和全基因组测序,此方法也叫做DNA∶RNA免疫沉淀测序技术(DNA∶RNA hybrid ...