p1 = p + stat_compare_means() #default Wilcoxon p2 = p +stat_compare_means(method = "t.test") p1 + p2 (2)标签显示格式 #标签位置 p1 = p + stat_compare_means(label.x.npc = "left", # label.x = 1.5, label.y = 40 label.y.npc = "top") #标签内容 p2 = p + stat_compare...
1、加载包 library(ggplot2) library(ggpubr) 在ggpubr包中有两个函数可以进行计算两组或多组数据间的比较, compare_means() stat_compare_means( ) 2、两个独立样本t 检验 compare_means(len ~ supp, data = ToothGrowth) ## # A tibble: 1 × 8 ## .y. group1 group2 p p.adj p.format p....
一、用aes函数映射 stat_compare_means(aes(group=group),method="wilcox.test",hide.ns=F,na.rm=T,label="p.signif") 这个方法可以在组内进行比较 二、用comparison添加 stat_compare_means(method="wilcox.test",comparison=comparison,#必须是个List hide.ns=F,label="p.signif") 这个只能在组间进行比较...
对手头的数据,你需要对每个变量按照固定分组画一个boxplot,并加上Kruskal-Wallis多组检验结果及post-hoc两两比较结果,其中两两比较的结果只需要有显著性的。以此画多个图后将他们“拼图”成一个。 以iris数据集为例,根据以下代码用ggplot2绘制了"Sepal.Width"变量的基本箱线图,并用ggpubr包的stat_compare_means(...
ggplot(data = mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) + geom_point() + stat_smooth() + facet_grid(~ am) 1. 2. 3. 4. ggplot2 包中的主题(theme)函数用于定义绘图的风格,例如画布的背景。下图是一个黑白主题画布背景示例: ggplot(data = mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) + ...
一、ggplot2 模板: ggplot(data = <DATA>)+ <GEOM_FUNCTION>(mapping =aes(<MAPPINGS>)) 注意: 低级绘图函数单独使用会报错,需依附于高级绘图函数。 ggplot2特殊语法:列名不带引号,行末写加号! 1.属性设置 fill管实心,color管边框 1.1手动设置,需要设置为有意义的值 ...
ggplot2绘图系统——扩展包ggrepel、ggsci、gganimate、ggpubr等 部分扩展包可在CRAN直接下载,有些需借助devtools包从Github下载。 1. ggrepel包 用来在图上添加文字和标签,相比geom_text和geom_label函数,能将重叠的标签分开,并添加指示短横线。 library(ggrepel) ...
ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg))+geom_point()+stat_smooth()+facet_grid(~am) ggplot2 包中的主题(theme)函数用于定义绘图的风格,例如画布的背景。下图是一个黑白主题画布背景示例: 代码语言:javascript 复制 ggplot(data=mtcars,aes(x=wt,y=mpg))+geom_point(aes(color=am))+stat_smooth()+theme...
install.packages("ggplot2")install.packages("ggpubr")library(ggplot2)library(ggpubr)#设置工作目录(这里注意R中'/'和Windows中'\'是不同的)setwd("D://桌面内容//test")#读取输入文件library(readxl)data<-read_excel("D:/桌面内容/test/data.xlsx")#提取data数据集中第2列,第3列的列名 ...
stat_compare_mean():自动添加p-value、显著性标记到ggplot图中 ##compare_means()函数 该函数主要用用法如下: compare_means(formula, data, method = "wilcox.test", paired = FALSE, group.by = NULL, ref.group = NULL, ...) 注释: formula:形如x~group,其中x是数值型变量,group是因子,可以是一个...