# p + stat_compare_means(label = "p.signif", label.x = 1.5) p <- ggboxplot(ToothGrowth, x = "dose", y = "len", color = "supp", palette = "jco") p2 = p + stat_compare_means(aes(group = supp)) # p + stat_compare_means(aes(group = supp), label = "p.signif") p1...
Step3:ggpubr包绘制配对箱线图 ggpaired(data, x = "Group", y = "Expression", color = "black", fill = "Group", line.size = 0.5) + geom_line(aes(group = paired), color = "grey80") + stat_compare_means(paired = TRUE, size = 2) +facet_wrap(~ Type, scales = 'free_x', nro...
+geom_errorbar(aes(ymin=Value, ymax=Value+sd), width=.3,position=position_dodge(.9))+geom_jitter(data=Figure_2c,aes(x=Group,y=Value),size=2,width =0.3,height =0.1,color="black",alpha=0.3,fill="transparent")+la...
p<-ggboxplot(ToothGrowth,x="supp",y="len",color="supp",palette="jco",#add = "jitter",facet.by="dose",short.panel.labs=F)p1=p+stat_compare_means(label="p.format")# p + stat_compare_means(label = "p.signif", label.x = 1.5)p<-ggboxplot(ToothGrowth,x="dose",...
用到 stat_compare_means 函数 两种用法: 一、用aes函数映射 stat_compare_means(aes(group=group),method="wilcox.test",hide.ns=F,na.rm=T,label="p.signif") 这个方法可以在组内进行比较 二、用comparison添加 stat_compare_means(method="wilcox.test",comparison=comparison,#必须是个List ...
stat_compare_means(label.y=50) #总体比较p值位置 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. 10. 11. 条形图和滑珠图 滑珠图是条形图一种变形。 示例比较。 mtcars$name <- rownames(mtcars) mtcars$cyl <- as.factor(mtcars$cyl) #条形图 a <- ggbarplot(mtcars,x='name',y='mpg', ...
stat_compare_means(label.y = 9) ggpubr 三、图片保存 1.ggplot ggsave("name.png") ggsave(p, filename = "name.png") 2.三段式 保存的格式和文件名:pdf("test.pdf") 作图代码:... 关闭画板:dev.off 3.eoffice:导入到PPT library(eoffice) ...
ggplot(drawdata1, aes(Type, LDHA,color=Type),color = "Type" )+ geom_econodist(width = 0.5) + stat_compare_means(comparisons = my_comparisons)与ggplot2::geom_boxplot()一样,可以传入“ymin”、“median”和“ymax”的预计算值,也可以传入一个y列,然后使用stat_econodist()计算所...
在SCI论文中,经常需要在图表中添加数据显著性标记。在R语言中,可以使用ggpubr包中的stat_compare_means函数轻松添加统计显著性标记。 首先,加载ggpubr包: ```r library(ggpubr) ``` 然后,在绘制图表时使用stat_compare_means函数: ```r ggplot(data, aes(x=x, y=y)) + ...
箱线用于几个样本的比较,单从图上来看我们很难判断这三组样本之前是否显著差异,因此我们再添加统计层。 > p <- p+stat_compare_means(comparisons = list(c("0.5", "1"), c("1", "2"), c("0.5", "2")),label= "p.signif") > p 供稿:熊潇...