QTL-seq是一种将Bulked‐segregant analysis (BSA)和高通量测序相结合,快速定位质量性状或数量性状主效QTL的方法[1]。 BSA方法最早使用RLFP或其他分子标记,分别在番茄中鉴定到果实脱落和成熟相关的基因组片段和标记[2],在生菜中鉴定到和抗霜霉病基因连锁的分子标记[3]。 BSA原理1 ...
QTL-seq是一种结合混池分离分析(Bulked segregant analysis,BSA)和高通量测序的方法[1],这种方法对于质量性状 QTL 或数量性状主效 QTL 定位具有省时省力省钱的特点。我们在前面已经介绍过QTL-seq分析的原理以及如何计算QTL-seq中的的置信区间。这里我们介绍如何使用R包easyQTLseq进行QTL-seq分析。 easyQTLseq包的一...
QTL-seq是一种将Bulked‐segregant analysis (BSA)和高通量测序相结合,快速定位质量性状或数量性状主效QTL的方法[1]。 BSA方法最早使用RLFP或其他分子标记,分别在番茄中鉴定到果实脱落和成熟相关的基因组片段和标记[2],在生菜中鉴定到和抗霜霉病基因连锁的分子标记[3]。 BSA原理1 BSA原理2 选取目标性状有差异的...
QTL-seq是一种结合混池分离分析(Bulked segregant analysis,BSA)和高通量测序的方法[1],这种方法对于质量性状 QTL 或数量性状主效 QTL 定位具有省时省力省钱的特点。我们在前面已经介绍过QTL-seq分析的原理以及如何计算QTL-seq中的的置信区间。这里我们介绍如何使用R包easyQTLseq进行 QTL-seq 分析。 easyQTLseq 包...
QTL-Seq MutMap 蛋白质组学和代谢组学 纯测序 产品简介 常见问题 经典案例 结果展示 QTL-Seq:快速QTL定位 将两个具有极端性状的亲本杂交,得到F1,F1自交得到F2,出现性状分离。 将F2中具有极端性状的个体分别混池测序,同时对两个亲本进行测序。 分别计算SNP-Index,差异显著大于0的SNP位点作为候选QTL位点。科技...
QTL-seq目前已成功对油黄瓜开花性状、番茄果实重量、鹰嘴豆百粒重跟根性状、木豆枯萎病与不育花叶病抗性等研究定位。 微分基因采用QTL-seq方法进行目标性状定位,结合公司丰富的项目经验,专业的项目方案和分析流程,可有效找到候选基因并缩小目标基因范围。
TECHNICAL ADVANCE/RESOURCEQTL-seq: rapid mapping of quantitative trait loci in rice bywhole genome resequencing of DNA from two bulkedpopulationsHiroki Takagi 1,2 , Akira Abe 2,3 , Kentaro Yoshida 1 , Shunichi Kosugi 1 , Satoshi Natsume 1 , Chikako Mitsuoka 1 , Aiko Uemura 1 ,Hiroe Ut...
/lustre/Work/project/genome/20170523_Oryza_sativa_BSA/01.QTL-seq/ 一、工作原理 所需文件:1个亲本数据,2个混池数据 1.将亲本数据比对到参考基因组,进行snp检测; 2.将参考基因组的snp位点进行碱基替换,构建新的reference; 3.将亲本数据比对到新的参考基因组,进行snp检测,用于后续混池的过滤; ...
QTL-seq流程说明文档版本号v1.0撰写日期:2017.6.26撰写者:柯文斯目录一、分析流程 2二、调参示例 7示例:/lustre/Work/project/genomeOryza_sativa_BSA/01.QTL-seq/一、工作原理所需文件:1个亲本数据,2个混池数据将亲本数据比对到参考基因组,进行snp检测;将参考基因组的snp位点进行碱基替换,构建新的reference;将...
1 QTL-seq 流程说明文档 版本号 v1.0 撰写日期:2017.6.26 撰写者:柯文斯 阅读了该文档的用户还阅读了这些文档 27 p. 最新学校家庭社会协同育人机制构建PPT课件 52 p. 综合虫害管理知识培训PPT课件 32 p. 子宫肌瘤查房分享子宫平滑肌瘤护理PPT课件 134 p. 装饰材料与构造PPT讲解课件 40 p. 专项安全...