两种技术本身存在差异: 转录组测序是基于检测样品里所有基因整体上的表达情况,qPCR是特异性设计引物对基因的局部区域做相对定量的,两者的技术原理是存在一定不同的,所以转录组和qPCR确实有可能存在并没有非常一致的情况的,一般来说主要看大部分基因的趋势一致就行的。 备注(一种比较特别的情况): 为什么敲除基因A的2...
首先需要把QPCR的相对表达量以及RNA-seq测序的差异结果提取并整理成如下格式。需要注意的是,为了方便作图,QPCR的相对表达量及RNA-seq的差异结果都需要进行对数处理(其中,RNA-seq的测序分析结果中一般是直接有log2FC的数据,可以直接使用)。 作图时,我们使用的是log2FC(RNA-seq)以及log2FC(QPCR)两列数据。为了方便...
选择的内参基因在不同样品里是否稳定表达,是另一个影响qPCR相对定量结果的关键因素。 6、两种技术本身存在差异: 转录组测序是基于检测样品里所有基因整体上的表达情况,qPCR是特异性设计引物对基因的局部区域做相对定量的,两者的技术原理是存在一定不同的,所以转录组和qPCR确实有可能存在并没有非常一致的情况的,一般来...
选择的内参基因在不同样品里是否稳定表达,是另一个影响qPCR相对定量结果的关键因素。 6、两种技术本身存在差异: 转录组测序是基于检测样品里所有基因整体上的表达情况,qPCR是特异性设计引物对基因的局部区域做相对定量的,两者的技术原理是存在一定不同的,所以转录组和qPCR确实有可能存在并没有非常一致的情况的,一般来...
b.将qPCR和转录组的数据整理(qPCR和RNA-seq的log2fc、qPCR的标准差)成表; C.基于前3列用excel绘制柱状图,然后添加qPCR的误差线(自定义设置:±标准差)。 2、柱状图+折现图: a.基于1b里整理完的数据,在excel里插入组合图; B.给柱状图增加误差线,调整下,出图。